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一种与茄子单花单果性状基因紧密连锁的Indel分子标记及其应用

来源：花匠小妙招时间：2025-06-17 16:47

本发明属于分子标记，尤其涉及一种与茄子单花单果性状基因紧密连锁的indel分子标记及其应用。

背景技术：

1、茄子是我国重要的茄果类蔬菜作物，当前播种面积超过1300万亩。花是植物从营养生长到生殖生长的重要器官，也是影响植物果实的重要因素。茄子的花主要有单主花和主花加多副花(也称为腋花或侧花)的多种形式存在。茄子单花单果的特点主要体现在其生长习性和产量控制上，这些特点对于茄子的种植和管理具有重要意义。以下是对茄子单花单果优点的详细分析：1、生长习性优势：(1)养分集中供应：由于茄子是单花单果，每朵花只结一个果实，这使得植株能够更集中地将养分供应给每一个果实，有利于果实的充分发育和品质提升。(2)减少养分竞争：相比多花多果的作物，单花单果的茄子减少了果实之间的养分竞争，使得每个果实都能获得充足的营养，从而提高果实的整体品质和产量。(3)稳定产量：单花单果的生长模式有助于稳定茄子的产量，减少因养分分配不均导致的果实大小不一、品质参差不齐的问题。2、管理便利性：(1)简化修剪工作：在茄子的生长过程中，种植者可以根据需要进行修剪，去除多余的侧枝和花朵，以集中养分供给主枝和果实。由于茄子是单花单果，这种修剪工作相对简单且目标明确。(2)病虫害防控：单花单果的茄子在病虫害防控方面也具有一定优势。由于果实数量相对较少，种植者可以更容易地监测和防治病虫害，减少农药的使用量，降低生产成本并保护生态环境。3、提高果实品质，(1)果实发育充分：由于养分集中供应和减少养分竞争，单花单果的茄子果实能够发育得更加充分，果肉更加厚实、口感更佳。(2)外观和口感：单花单果的茄子在外观上通常更加整齐、美观，色泽鲜艳；在口感上则更加细腻、多汁，符合消费者的需求。

2、综上所述，茄子单花单果的优点主要体现在养分集中供应、减少养分竞争、稳定产量、管理便利性以及提高果实品质等方面。这些优点使得茄子在种植和管理上更加容易控制，同时也能够生产出更高品质的果实来满足市场需求，能够增强产品在市场上的竞争力，从而提高农户的经济效益，同时单花茄子的种植有助于降低生产成本，提升茄子商品性的同时也提高有效产量，简化田间管理，增加经济效益，因此，在种植茄子时，合理利用其单花单果的茄子品种是提高产量和品质的有效途径之一，因此研究茄子单花单果对于茄子育种和生产实践都有重大的意义。

技术实现思路

1、本发明的目的之一在于提供一种与茄子单花单果性状基因紧密连锁的indel分子标记，所述indel分子标记为indel分子标记1或indel分子标记2；所述indel分子标记1的核苷酸序列如seq id no.3所示，其中seq id no.3的第49-51位为插入或缺失变异，含有seqid no.3第49-51位插入序列的茄子为单花单果品种；所述indel分子标记2的核苷酸序列如seq id no.6所示，其中seq id no.6的第75-78位为插入或缺失变异，含有seq id no.6第75-78位插入序列的茄子为单花单果品种。

2、本发明的目的之二在于提供检测上述indel分子标记的物质在鉴定茄子单花单果品种/茄子育种中的应用。

3、优选地，所述物质含有扩增所述indel分子标记的pcr引物。

4、更优选地，所述pcr引物为引物对，所述引物对由正向引物和反向引物组成，所述正向引物为与茄子基因组dna中所述indel分子标记的上游特异结合的单链dna，所述反向引物为与茄子基因组dna中所述indel分子标记的下游特异结合的单链dna。

5、更优选地，扩增所述indel分子标记1的pcr引物如seq id no.1-2所示；扩增所述indel分子标记2的pcr引物如seq id no.4-5所示。

6、本发明的目的之三在于提供一种鉴定或辅助鉴定茄子单花单果品种的方法，所述方法包括以下步骤：

7、检测待鉴定茄子的基因组dna中indel分子标记1或indel分子标记2的基因类型，所述indel分子标记1的核苷酸序列如seq id no.3所示，其中seq id no.3的第49-51位为插入或缺失变异，含有seq id no.3第49-51位插入序列的茄子为单花单果品种；所述indel分子标记2的核苷酸序列如seq id no.6所示，其中seq id no.6的第75-78位为插入或缺失变异，含有seq id no.6第75-78位插入序列的茄子为单花单果品种。

8、本发明的目的之四在于提供一种鉴定或辅助鉴定茄子单花单果品种的方法，所述方法包括以下步骤：

9、(1)以待鉴定茄子基因组dna为模板，利用上述引物对进行pcr扩增，得到pcr产物；

10、(2)根据所述pcr产物含有上述indel分子标记的基因类型来鉴定茄子是否为单花单果品种；

11、所述indel分子标记1第49-51位为插入或缺失变异，含有其第49-51位插入序列的茄子为单花单果品种；所述indel分子标记2第75-78位为插入或缺失变异，含有其第75-78位插入序列的茄子为单花单果品种。

12、优选地，所述步骤(1)中利用引物对seq id no.1-2或seq id no.4-5进行pcr扩增时的体系如下：

13、

14、更优选地，所述步骤(1)中利用引物对seq id no.1-2或seq id no.4-5进行pcr扩增时的程序如下：

15、

16、与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：

17、本发明首次通过新一代高通量测序技术，对单花单果茄子和多花多果茄子全基因组多态性位点进行分析，筛选出该性状所在的目标区间，通过筛选indel分子标记，从中获得两个能有效甄别单花单果茄子的分子标记p1144b084和p1144b087。在常规育种方法中，茄子开花结果数量表型鉴定，要等到开花挂果之后才能进行，费时费力而且效率低下。通过检测茄子单花单果性状紧密连锁基因，可以在苗期进行淘汰，不仅节约生产成本，而且大大提高选择效率。本发明中茄子单花单果紧密连锁indel分子标记检测方便快速，结果稳定，不受环境影响。通过pcr扩增、pcr产物酶切和电泳检测分析，即可预测茄子开花数量，进而准确快速筛选单花单果茄子单株。

技术特征：

1.一种与茄子单花单果性状基因紧密连锁的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记为indel分子标记1或indel分子标记2；所述indel分子标记1的核苷酸序列如seqid no.3所示，其中seq id no.3的第49-51位为插入或缺失变异，含有seq id no.3第49-51位插入序列的茄子为单花单果品种；所述indel分子标记2的核苷酸序列如seq id no.6所示，其中seq id no.6的第75-78位为插入或缺失变异，含有seq id no.6第75-78位插入序列的茄子为单花单果品种。

2.检测权利要求1所述indel分子标记的物质在鉴定茄子单花单果品种/茄子育种中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述物质含有扩增所述indel分子标记的pcr引物。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述pcr引物为引物对，所述引物对由正向引物和反向引物组成，所述正向引物为与茄子基因组dna中所述indel分子标记的上游特异结合的单链dna，所述反向引物为与茄子基因组dna中所述indel分子标记的下游特异结合的单链dna。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，扩增所述indel分子标记1的pcr引物如seqid no.1-2所示；扩增所述indel分子标记2的pcr引物如seq id no.4-5所示。

6.一种鉴定或辅助鉴定茄子单花单果品种的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

7.一种鉴定或辅助鉴定茄子单花单果品种的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述步骤(1)中利用权利要求5中所述引物对进行pcr扩增时的体系如下：

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述步骤(1)中利用权利要求5中所述引物对进行pcr扩增时的程序如下：

技术总结
本发明公开了一种与茄子单花单果性状基因紧密连锁的Indel分子标记及其应用，属于分子标记技术领域。本发明首次通过新一代高通量测序技术，对单花单果茄子和多花多果茄子全基因组多态性位点进行分析，筛选出该性状所在的目标区间，通过筛选Indel分子标记，从中获得两个能有效甄别单花单果茄子的分子标记P1144B084(即Indel分子标记1)和P1144B087(即Indel分子标记2)。本发明中茄子单花单果紧密连锁Indel分子标记检测方便快速，结果稳定，不受环境影响，通过PCR扩增、PCR产物酶切和电泳检测分析，即可预测茄子开花数量，进而准确快速筛选单花单果茄子单株。

技术研发人员：王本启,张敏,谈杰,黄树苹,张洪源,陈霞,陈蓉,王俊良
受保护的技术使用者：武汉市农业科学院
技术研发日：
技术公布日：2024/11/28