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与茄子果皮中花青素相关的KASP分子标记及其应用

来源：花匠小妙招时间：2025-06-17 16:37

本发明属于生物，更具体地，本发明涉及一种与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记及其应用。

背景技术：

1、花青素(anthocyanidin)又称花色素，是自然界一类广泛存在于植物中的水溶性天然色素，是水果、蔬菜、花卉中的主要呈色物质。在植物细胞液泡不同的ph值条件下，花青素使花瓣呈现五彩缤纷的颜色。花青素主要的类型有6种，即天竺葵色素、矢车菊色素、飞燕草色素、芍药色素、牵牛花色素和锦葵色素。自然状态的花青素都以糖苷形式存在，称为花色苷，很少有游离的花青素存在。花青素主要用于食品着色方面，也可用于染料、医药、化妆品等方面。

2、茄子(solanum melongena l.，2n＝24)，别名落苏、又名昆仑瓜等，是茄科茄属一年生草本至亚灌木植物，因其良好的口感，丰富的营养物质，且是可以连年供应的大众蔬菜，是我国、东南亚及非洲等许多国家重要的蔬菜作物之一。茄子营养物质含量丰富，果实中含有蛋白质、脂肪、碳水化合物、胡萝卜素、叶绿素、花青素、各种维生素及生物碱等成分。茄子果实具有食用方式多样，口感好等特点，且价格经济实惠，深受广大消费者喜爱。

3、中国作为茄子的第二起源地及次生演化中心，具有丰富的茄子种子资源。茄子的农艺性状多种多样，其中茄子果实颜色是茄子最直观的农艺性状之一。目前已有的茄子品种中，果实颜色有紫黑色、紫红色、浅紫色、绿色和白色等，丰富的果实颜色和种类给消费者提供了更多的选择性。茄子果色的颜色主要由花青素和叶绿素的含量决定。在茄子中，花青素含量决定果皮紫色的深浅；叶绿素赋予果皮绿色，当果皮中没有花青素或花青素浓度较低时，果实表现为绿色；当花青素和叶绿素共存时，果实呈现紫黑色；如果花青素和叶绿素均不存在时，果实则表现为白色。

4、目前关于调控茄子果实中花青素的基因及转录因子已有很多人研究，然而大多都是通过转录组、代谢组、gwas(全基因组关联分析)分析等生物信息学手段，难以转化为有效的分子标记并且应用。现有研究中与茄子果实紫色性状紧密连锁的kasp分子标记较少，且利用开发的kasp分子标记，在自然群体验证时其准确度也不够高。

5、因此，开发与茄子果皮中花青素性状紧密连锁的、可高效且准确鉴定茄子果皮中是否含有花青素的kasp分子标记非常有意义。

技术实现思路

1、基于此，本发明的目的在于提供一种与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记及其应用，利用该kasp分子标记，可以高效鉴定茄子果皮中是否含有花青素，且在自然群体验证时基因型与表型对应准确率高。

2、实现上述发明目的的技术方案包括如下。

3、本发明中的第一方面，提供了一种与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记，所述kasp分子标记位于茄子基因组10号染色体的76516913位，在76516913位碱基发生c→g的点突变。

4、本发明的第二方面，提供了扩增上述与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记的kasp引物，所述kasp引物包括序列如seq id no:1所示的上游引物fp1、序列如seq id no:2所示的上游引物fp2、以及序列如seq id no:3所示的下游引物r。

5、本发明的第三方面，提供了上述kasp分子标记或kasp引物在茄子果皮颜色的早期鉴定、果皮中含有花青素的茄子品种辅助育种或制备检测茄子果皮颜色的试剂盒中的应用。

6、本发明的第四方面，提供了一种检测茄子果皮颜色的试剂盒，包括上述扩增上述与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记的kasp引物。

7、本发明的第五方面，提供了一种鉴定茄子果皮颜色的方法，包括以下步骤：以待鉴定茄子的dna作为模板，以上述kasp引物为扩增引物，进行pcr扩增后，分析基因分型数据。

8、本发明具有以下有益效果：

9、本发明基于精细定位开发了鉴定茄子果皮中是否有花青素的kasp分子标记21qp381，并以来自全国各地的264份茄子品种为材料，验证kasp分子标记21qp381的适用性，结果发现基因型与表型对应准确率高达97.35％，表明本发明开发的分子标记具有更好的适用性，且kasp分子标记21qp381在f2、f3、f4和自然群体中的基因分型非常清楚。利用本发明的kasp分子标记21qp381可在茄子幼苗期实现高通量快速鉴定茄子果实的颜色，筛选出紫茄和非紫色茄子，为茄子分子标记辅助选择育种提供技术支持，在生产上具有重要的应用价值。

技术特征：

1.一种与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记，其特征在于，所述kasp分子标记位于茄子基因组10号染色体的76516913位，在76516913位碱基发生c→g的点突变。

2.一种扩增上述与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记的kasp引物，其特征在于，所述kasp引物包括序列如seq id no:1所示的上游引物fp1、序列如seq id no:2所示的上游引物fp2、以及序列如seq id no:3所示的下游引物r。

3.权利要求1所述的kasp分子标记或权利要求2所述的kasp引物在茄子果皮颜色的早期鉴定中的应用。

4.权利要求1所述的kasp分子标记或权利要求2所述的kasp引物在果皮中含有花青素的茄子品种辅助育种中的应用。

5.权利要求1所述的kasp分子标记或权利要求2所述的kasp引物在制备检测茄子果皮颜色的试剂盒中的应用。

6.一种检测茄子果皮颜色的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述的扩增上述与茄子果皮中花青素相关的kasp分子标记的kasp引物。

7.一种鉴定茄子果皮颜色的方法，其特征在于，包括以下步骤：以待鉴定茄子的dna作为模板，以权利要求2所述的kasp引物为扩增引物，进行pcr扩增后，分析基因分型数据。

8.根据权利要求7所述的鉴定茄子果皮颜色的方法，其特征在于，所述pcr扩增的反应体系包括：kasp mix 2.5±0.1μl、8～12μm上游引物fp10.075±0.005μl、8～12μm上游引物fp20.075±0.005μl、8～12μm下游引物r 0.2±0.05μl、模板dna 2±0.2μl、ddh2o加至5μl。

9.根据权利要求7所述的鉴定茄子果皮颜色的方法，其特征在于，所述pcr扩增的反应程序为：

10.根据权利要求7～9任一项所述的鉴定茄子果皮颜色的方法，其特征在于，所述分析基因分型数据包括以下步骤：基因型为g/g时，果皮颜色为绿色；基因型为c/c时，果皮颜色为紫黑色；基因型为c/g时，果皮颜色为紫黑色。

技术总结
本发明公开了一种与茄子果皮中花青素相关的KASP分子标记及其应用，所述KASP分子标记位于茄子基因组10号染色体的76516913位，在76516913位碱基发生C→G的点突变。本发明基于精细定位开发了鉴定茄子果皮中是否有花青素的KASP分子标记21QP381，并以来自全国各地的264份茄子品种为材料，验证KASP分子标记21QP381的适用性，结果表明本发明开发的分子标记具有更好的适用性。利用本发明的KASP分子标记21QP381可在茄子幼苗期实现高通量快速鉴定茄子果实的颜色，筛选出紫茄和非紫色茄子，为茄子分子标记辅助选择育种提供技术支持，在生产上具有重要的应用价值。

技术研发人员：邱正坤,夏志磊,曹必好,颜爽爽,杨梦
受保护的技术使用者：华南农业大学
技术研发日：
技术公布日：2025/2/27