一种经济实惠且方便的诊断标记，用于识别啤酒花的雄性和雌性,G3: Genes, Genomes, Genetics

一种经济实惠且方便的诊断标记，用于识别啤酒花的雄性和雌性
G3: Genes, Genomes, Genetics ( IF 2.1 ) Pub Date : 2023-11-14 , DOI: 10.1093/g3journal/jkad216
Shaun J Clare 1 , Ryan M King 1 , Anna L Tawril 2 , Joshua S Havill 3 , Gary J Muehlbauer 3 , Sarah B Carey 4 , Alex Harkess 4 , Nahla Bassil 1 , Kayla R Altendorf 2

啤酒花生产仅利用雌性植物，而雄性植物仅用于通过杂交在育种计划中产生新的变异。目前，啤酒花缺乏快速准确的诊断标记来确定植物是雄性还是雌性。如果没有诊断标记，育种计划可能需要 1-2 年才能确定新苗的性别。以前对性别连锁标记的研究仅限于特定群体或育种计划，因此可转移性有限或可扩展性低。大量具有已知性别表型的 765 个啤酒花基因型、测序基因分型和全基因组关联图谱揭示了性染色体上的一个高度显着的标记（LOD 评分 = 208.7），该标记以 96.2% 的准确度预测我们群体中的性别。在这项研究中，我们开发了一种用于诊断 SNP 的 PCR 等位基因竞争性延伸 (PACE) 测定法，并测试了三种用于快速、高通量基因分型的快速 DNA 提取方法。此外，该标记在来自华盛顿州普罗瑟市 USDA-ARS 啤酒花育种计划的 15 个家族的 94 个人的单独群体中进行了验证，准确度为 96%。该诊断标记位于预计编码基本螺旋-环-螺旋转录因子蛋白的基因中，这是一个先前与多种植物物种的雄性不育有关的蛋白质家族，这可能表明在确定啤酒花性别中的作用。该标记具有诊断性、准确性、经济性和高度可扩展性，并且具有提高啤酒花育种效率的潜力。

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更新日期：2023-11-14

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