通过综合生物信息学分析识别精神分裂症外周血中的关键生物标志物并筛选治疗药物,Journal of Psychiatric Research

通过综合生物信息学分析识别精神分裂症外周血中的关键生物标志物并筛选治疗药物
Journal of Psychiatric Research ( IF 3.7 ) Pub Date : 2022-06-09 , DOI: 10.1016/j.jpsychires.2022.06.007
Mengtong Xie 1 , Zhijun Li 1 , Xinwei Li 1 , Lizhe Ai 1 , Mengdi Jin 1 , Ningning Jia 1 , Yuqing Yang 1 , Weizhen Li 1 , Fengyu Xue 1 , Min Zhang 1 , Qiong Yu 1

精神分裂症 (SCZ) 是一种复杂的神经发育障碍，但其机制仍然不明确。因此，我们分析了转录组数据集以研究 SCZ 的分子机制，以查明新的生物标志物并建议治疗药物。从基因表达综合 (GEO) 数据库中检索到四个外周血数据集，通过稳健的秩聚合 (RRA) 方法确定了总共 27 个稳健的差异表达基因 (DEG)。由 Enrichr 平台执行的富集分析表明，DEG 主要参与免疫和炎症。蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络由 STRING 构建，然后由 Cytoscape 可视化。由cytohubba插件识别的Hub基因有CXCL2、TLR9、SLPI、LY96、G0S2、EGR2、SELENBP1、NDUFA4、GNLY、CCL22。应用CIBERSORT算法评估免疫浸润情况，揭示了T细胞CD8、T细胞CD4记忆静息和巨噬细胞M0的差异。采用NetworkAnalyst平台检测与DEGs相互作用的转录因子（TFs）、microRNAs（miRNAs）、疾病和化学物质，而与DEGs相互作用的药物则由Enrichr检测。FOXC1、GATA2、NFIC、USF2、E2F1 等 TF，mir-16-5p、mir-1-3p、mir-124-3p、mir-155-5p、mir-27a-3p 等 miRNA 在调节度数。mir-367-SMAD7-EGR1、mir-367-SMAD7-ARNT、mir-21-SMAD7-EGR1 可能是 SCZ 的有希望的生物标志物。DEGs与心肌缺血、炎症、再灌注损伤密切相关。VPA、环孢菌素、黄曲霉毒素 B1、三氧化二砷、二苯吡咯啉、甲氧苄啶、4-氨基苯甲酰肼等药物，毛花苷 C 可能对 SCZ 的治疗具有重要意义。这些结果将阐明 SCZ 的分子机制，并提出有希望的外周血诊断生物标志物和治疗策略。

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更新日期：2022-06-09

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