枸杞DFR基因cDNA片段的克隆及生物信息学分析

【摘要】：二氢黄酮醇4-还原酶(DFR,1.1.1.219)是类黄酮代谢中花青素合成的一种主要调控酶,它依赖NADPH还原二氢黄酮醇为无色花色素。以枸杞为材料,利用序列同源原理和RT-PCR技术得到1条DFR基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因的cDNA片段长为893 bp,编码297个氨基酸,蛋白分子量为33.94 ku,等电点为6.08。氨基酸序列和结构分析显示DFR基因具有典型的NAD(P)-binding Rossmann-fold结构域。LyDFR蛋白很可能定位在细胞质。二级结构和三级结构进行预测,发现LyDFR蛋白中无规则卷曲114个,α螺旋和β折叠分别为124个和18个,延伸链41个。系统进化分析表明,枸杞LyDFR基因与马铃薯和番茄的DFR基因具有很高的同源性。这个基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为KC795560。

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