三角梅SOD基因家族成员的克隆与生物信息学分析

【摘要】：SOD基因家族在植物对抗活性氧破坏细胞膜透性及保护细胞膜完整性中有着重要作用。本研究以伊丽莎白·安格斯(Bougainvillea glabra"Elizabeth Angus")为模板,得到了Fe-SOD基因保守序列片段及Cu/ZnSOD和Mn-SOD基因全长序列,其中,胞质型CSD共2种编码类型:cy CSD1型和cy CSD2型,其分子式分别为C_(920)H_(1507)N_(265)O_(298)S_(17)和C_(863)H_(1415)N_(249)O_(272)S_(15),开放阅读框(ORF)全长分别为585 bp和543 bp,编码氨基酸长度分别为194个和180个,蛋白相对分子量分别为21.59 k D和20.11 k D,理论等电点(p I)分别为8.12和9.16,皆属不稳定的碱性疏水蛋白;Mn-SOD具有711 bp ORF,编码236个氨基酸,相对分子量为26.33 k D,分子式为C_(1191)H_(1849)N_(321)O_(340)S_7,p I为7.84,属稳定的偏碱性疏水蛋白。膜结构预测结果表明,cy CSD 1型蛋白可能与cy CSD 2型蛋白皆可能存在2个跨膜螺旋,长度分别为17个和19个氨基酸,17个和21个氨基酸;MSD蛋白没有发现跨膜结构域,可能不存在跨膜螺旋。亚细胞定位结果表明,cy CSD蛋白推定定位在细胞质膜;MSD蛋白定位于线粒体质膜。研究推测,所得基因序列为三角梅SOD基因家族成员。

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