基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析

在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157~0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15~50个氨基酸间的保守基序。它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征。最后,通过q RT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程。 （共11页)

相关知识

基于组学的野蔷薇抗白粉病相关基因表达分析与载体构建
琼花不孕花和可孕花转录组分析及发育过程形态结构观察
红鳍笛鲷皮肤转录组分析及体色相关基因克隆、表达与进化研究
山茶花花香成分鉴定及相关基因的转录组分析
百合属5种植物的比较转录组分析
花卉研究专题｜基因组多组学如何助力解析花香研究？
花卉研究所与华中农业大学合作在蔷薇属花香合成研究方面取得重要进展
转录组+蛋白组联合揭秘枇杷花的发育机制
大花香水月季栽培及品种详解
毛华菊CvCRY2基因的克隆、生物信息学及表达分析

网址: 基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析 https://www.huajiangbk.com/newsview626829.html