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贾惊宇/程细高/刘希娟等NC：辣椒素饮食抑制"长高"的肠-骨轴机制
Nature Communications——[15.7]
① 研究背景与设计：特发性矮小症（ISS）病因不明，本研究利用多中心临床样本及大鼠模型，探究辣椒素通过肠-骨轴影响纵向骨生长的分子机制。② 核心发现与意义：研究表明长期辣椒素饮食引发肠道微炎症，通过外泌体miR-17-3p升高抑制软骨细胞增殖，并开发靶向生长板的工程化外泌体疗法。③ 生物标志物鉴定：ISS患儿血浆外泌体中miR-17-3p显著上调，其水平与身高呈负相关，能有效区分ISS与健康儿童。④ 分子机制解析：过表达miR-17-3p通过直接靶向ZNF148/SOS1轴，抑制下游RAS/MEK和PI3K/AKT信号通路，导致软骨细胞阻滞于G0/G1期并下调COL10A1等成骨基因。⑤ 饮食诱导模型：0.01%辣椒素饮食导致幼年大鼠矮小表型，虽GH/IGF-1激素水平正常，但血浆及肠组织miR-17-3p显著升高，重现了ISS的临床病理特征。⑥ 肠骨轴致病机理：辣椒素激活肠上皮细胞NF-κB信号通路，驱动miR-17-3p生成与外泌体分泌；ISS患儿粪便中miR-17-3p与炎症因子TNF-α同步升高佐证了该关联。⑦ 靶向干预策略：表面修饰II型胶原肽的工程化外泌体（ET-Exo）可靶向软骨，负载miR-17-3p拮抗剂与生长激素，可恢复模型大鼠身高且未见明显器官毒性。
【原文信息】
Capsaicin diet drives gut inflammation and exosomal miR-17-3p elevation in idiopathic short stature
2025-12-30 , doi: 10.1038/s41467-025-67883-2
黄秀娟/苏奇等NC：孤独症有独特的饮食-菌群关联特征，合成乳化剂具破坏作用
Nature Communications——[15.7]
① 研究背景与设计：本研究对818名中国儿童（462例孤独症（ASD），356例对照）进行粪便宏基因组与饮食评估，系统解析ASD特异性饮食-微生物组互作机制。② 核心发现与意义：ASD儿童表现出增强的饮食-菌群关联网络，合成乳化剂（聚山梨酯-80、卡拉胶）摄入与微生态网络结构破坏显著相关，提示针对性饮食管理在ASD干预中的潜在价值。③ 饮食质量关联：低质量饮食关联ASD症状、胃肠道并发症及异常进食行为，健康饮食指数（CCDI）仅在ASD组与微生物失调评分呈显著负相关。④ 特异性菌群响应：ASD组中Megamonas funiformis等菌丰度与健康饮食（高CCDI、高蛋白）正相关，蛋白质摄入对该组菌群影响显著强于对照。⑤ 乳化剂破坏网络：高水平乳化剂暴露关联ASD微生态网络连通性降低及Ruminococcus sp. AF13减少，模拟节点攻击证实ASD微生态网络在乳化剂压力下更显脆弱。⑥ 标志物稳定性：ASD诊断性微生物特征在不同饮食和药物背景下保持稳定，证实其作为独立诊断工具的稳健性。⑦ 潜在介导机制：Coprococcus eutactus等菌可能通过代谢调控，部分介导蛋白质及锌摄入对ASD行为症状的改善作用。
【原文信息】
Distinct diet-microbiome associations in autism spectrum disorder
2025-12-31 , doi: 10.1038/s41467-025-67711-7
张美玲等：宋氏鲸杆菌ZNN-1如何增强肠屏障？
Journal of Advanced Research——[13]
① 研究背景与设计：结合尼罗罗非鱼、小鼠类器官及人LS174T细胞模型与多组学技术，探究大豆粕（SM）饮食驱动的菌群变化对肠道屏障的调控机制。② 核心发现与意义：研究揭示了SM饮食富集的宋氏鲸杆菌（C. somerae）ZNN-1菌株通过分泌谷氨酰胺抑制宿主Notch通路，促进杯状细胞分化并增强肠道屏障，阐明了跨物种保守的“饮食-菌群-宿主”互作机制，为开发调节肠道干细胞分化的微生态干预提供依据。③ 饮食驱动菌株富集：SM饮食显著富集了鱼肠道中的鲸杆菌属；分离株ZNN-1基因组中富含碳水化合物代谢基因，大豆碳水化合物是其增殖的关键驱动力。④ 增强屏障功能：补充ZNN-1显著增加鱼肠道杯状细胞及黏蛋白muc2表达，上调紧密连接蛋白，增强肠屏障功能，提高致病菌感染后的宿主存活率。⑤ 锁定Notch通路：肠道转录组分析及体外实验显示，ZNN-1显著抑制Notch信号通路（dll4、hes1等下调），进而上调杯状细胞分化驱动因子spdef。⑥ 活性组分筛选：人LS174T细胞和小鼠类器官实验表明，ZNN-1菌体裂解液能剂量依赖性地下调DLL4和HES1，解除对SPDEF及MUC2表达的抑制。⑦ 效应分子鉴定与验证：非靶向代谢组学分析锁定谷氨酰胺为关键差异代谢物，且ZNN-1有完整的谷氨酰胺合成基因（gltD和glnA）；谷氨酰胺处理复现了抑制Notch通路并促进分化的表型，证实其为核心效应分子。
【原文信息】
Cetobacterium somerae ZNN-1 promotes goblet cell differentiation through glutamine-mediated Notch signaling suppression
2025-12-28 , doi: 10.1016/j.jare.2025.12.046
顾青等：益生菌穿上"钙-植物酚"外衣，重塑生物膜治疗结肠炎
Advanced Materials——[26.8]
① 研究背景与设计：针对IBD中脱硫弧菌（Des）生物膜引起的定植抵抗难题，本研究利用Ca2+和山奈酚-3-O-芸香糖苷（KAE）修饰益生菌植物乳植杆菌（Lap），构建钙驱动的生物膜转化系统。② 核心发现与意义：该系统通过界面结合与钙稳态恢复双重机制，实现从病原菌Des到益生菌Lap的生物膜表型转化，克服定植短暂局限，并缓解结肠炎。③ 生物膜界面调控：Ca2+利用未饱和配位点与Des生物膜桥接，显著增强Lap结合亲和力，定向杀伤病原菌并释放生态位。④ 钙稳态与屏障修复：KAE与Ca2+协同上调肠上皮细胞钙通道蛋白，恢复Ca2+内流，促进MUC2黏蛋白分泌，线虫模型证实该系统有效恢复肠道钙水平。⑤ 体内炎症缓解：小鼠结肠炎模型中，该系统有效逆转结肠缩短，抑制TNF-α并提升抗炎因子IL-10水平，促进ZO-1等紧密连接蛋白重构。⑥ 长期定植与安全性：增强的黏附力使Lap在小鼠肠道定植超60天，且未引发血钙异常或主要器官病理损伤。⑦ 免疫激活与抗复发：单细胞测序表明，建立的Lap生物膜通过激活MHC-I途径增强CD8+ T细胞应答，降低中性粒细胞浸润，并抵御Des再入侵。
【原文信息】
Calcium-Powered Probiotics Reconfigure the Intestinal Niche via Biofilm Transformation
2025-12-30 , doi: 10.1002/adma.202516911
陈瑞/吴申申等：改造益生菌增强肠粘膜定植，改善菌群和肠炎
Small——[12.1]
① 研究背景与设计：针对炎症性肠病益生菌定植难题，本研究构建了负载药物芒柄花素、表面经硫醇化修饰及锰矿化处理的非转基因工程化大肠杆菌EcN（OME），利用小鼠模型评估疗效。② 核心发现：OME具备优异的肠道黏膜靶向定植能力，能协同递送药物与益生菌，通过上调特定肠菌及其效应因子，恢复肠道免疫稳态。③ 修饰与定植：利用Traut试剂修饰增加EcN细菌表面巯基，借二硫键交换显著增强与肠道黏蛋白的结合，有效提升其肠道滞留能力。④ 体内定植验证：口服后粪便DNA证实工程菌的肠道定植量显著增加，且锰矿化不影响细菌活性及靶向定植力，实现炎症部位长效滞留。⑤ 载药稳定性：通过锰生物矿化技术构建的壳核结构使细菌在模拟胃液中存活率>95%、药物保留率达83.4%，确保活性成分向肠道稳定递送。⑥ 疗效评估：OME治疗显著改善DSS结肠炎小鼠的体重、结肠长度及疾病活动指数，修复肠上皮屏障及紧密连接蛋白表达，且安全性良好。⑦ 机制解析：OME上调E. coprostanoligenes丰度，促进其分泌甲基丙二酰-CoA变位酶，调控Th17分化及T细胞功能，抑制炎症。
【原文信息】
Mucosal Colonized Engineered Nissle 1917 for Targeted Gut Delivery and Restored Microbiota Homeostasis in Inflammatory Bowel Disease
2025-12-28 , doi: 10.1002/smll.202507578
黄瑜/杨仕明/邢孟秋等："破冰船"仿生微机器人精准清除幽门螺杆菌
Advanced healthcare materials——[9.6]
① 研究背景与设计：针对幽门螺杆菌（H. pylori）感染难以根除及耐药性难题，本研究受破冰船启发，构建了一种集成铂纳米酶、链霉蛋白酶及胃上皮细胞膜的仿生微纳机器人（PtCsCa/PCM）通过物理穿透与化学杀菌协同作用。② 核心发现与意义：该微机器人能自主穿透胃粘液屏障并精准锚定病灶，在小鼠模型中实现了与标准三联疗法相当的杀菌效果，同时减轻炎症反应且不破坏肠道菌群稳态，为解决H. pylori深层定植和耐药问题提供了新范式。③ 多模态驱动机制：该微机器人利用CaCO3在胃酸中分解产生CO2气泡提供自主推力，配合释放的链霉蛋白酶局部降解粘液，克服了药物扩散的物理屏障。④ 精准靶向与杀菌：胃上皮细胞膜涂层赋予微机器人特异性识别H. pylori的能力，提升靶向率，随后利用铂纳米酶在酸性微环境中催化活性氧生成以破坏细菌膜结构。⑤ 生物安全性评价：与传统抗生素不同，该系统利用pH响应机制仅在胃部酸性环境激活氧化酶样活性，进入中性肠道环境后自动失活，避免了抗生素相关的肠道菌群失调。
【原文信息】
Bioengineered Microrobot for Targeted and Autonomous Eradication of Helicobacter pylori
2025-12-28 , doi: 10.1002/adhm.202505900
葛鹏玲/苏阳等：黄芪多糖纳米粒抑制肝癌的肠-肝轴机制
Journal of Experimental and Clinical Cancer Research——[12.8]
① 研究背景与设计：针对非酒精性脂肪肝（NAFLD）向肝细胞癌（HCC）进展，本研究利用DEN联合高脂饮食小鼠模型，设计结肠靶向的黄芪多糖-壳聚糖/果胶纳米颗粒（APs-CS/PT-NPs），通过肠-肝轴干预肝癌。② 核心发现与意义：该纳米颗粒通过重塑肠道菌群、提升乙酸水平并激活GPR43受体，阻断NF-κB通路，遏制脂肪肝向肝癌的转化。③ 纳米递送系统特性：APs-CS/PT-NPs粒径约276 nm，具备优异pH响应性，在模拟结肠环境（pH 7.4）释放率超85%，实现黄芪多糖肠道定点递送。④ 菌群重塑与代谢调控：治疗显著富集肠道双歧杆菌属（尤以假小链双歧杆菌为主），提升门静脉及肝脏中短链脂肪酸（特别是乙酸）水平。⑤ 分子机制验证：乙酸直接结合并激活GPR43受体，抑制肝细胞NF-κB通路磷酸化；敲低GPR43可逆转该抑癌效应。⑥ 病理改善与屏障修复：该疗法显著降低NAFLD-HCC小鼠肝脏脂肪变性、炎症及纤维化评分与肿瘤负荷，并上调肠道紧密连接蛋白表达，修复肠道屏障。⑦ 安全性与转化潜力：纳米制剂长期给药未见明显毒性；乙酸在人源HCC异种移植模型中抑瘤显著，为基于“肠-肝轴”的肝癌预防提供新策略。
【原文信息】
Colon-Targeted astragalus polysaccharide nanoparticles prevent NAFLD-Driven hepatocarcinogenesis via microbiota remodeling and NF-κB Inhibition
2025-12-20 , doi: 10.1186/s13046-025-03608-z
刘佳明/孙晶等：肠菌产物TMAO通过抑制HIF-1α加剧阿尔茨海默病
Gut Microbes——[11]
① 背景与实验设计：本研究针对肠道菌群及代谢物在阿尔茨海默病（AD）中的致病机理，利用AD患者队列、MAPT P301S转基因小鼠及细胞模型，结合多组学分析j进行探究。② 核心发现与意义：研究揭示Blautia coccoides通过分泌代谢物氧化三甲胺（TMAO）直接结合并抑制神经保护性蛋白HIF-1α的功能，从而加剧氧化应激与Tau蛋白磷酸化，表明其为潜在的AD干预靶点。③ 菌群临床关联：AD患者粪便中B. coccoides丰度显著升高且对血清p-Tau181水平具有阳性预测价值，在该小鼠模型中定植此菌会显著加剧认知障碍及神经病理损伤。④ 关键代谢物鉴定：功能基因分析证实B. coccoides携带CutC基因并能产生TMAO，其丰度与脑内TMAO水平呈正相关，且TMAO能穿透血脑屏障诱导神经元氧化损伤。⑤ 分子机制解析：TMAO直接结合于HIF-1α蛋白的235-238位点并抑制该信号通路，导致抗氧化蛋白（如HO-1、SOD2）下调，进而促进ROS积累和Tau病理，突变结合位点可逆转此效应。⑥ 因果关系验证：两样本孟德尔随机化分析支持血浆TMAO水平与AD痴呆严重度的因果关联，直接给予小鼠TMAO处理复现了菌群定植引起的突触蛋白丢失与认知恶化。
【原文信息】
Blautia coccoides-derived metabolite trimethylamine-N-oxide exacerbates Alzheimer's disease progression via targeting HIF1α signaling
2025-12-29 , doi: 10.1080/19490976.2025.2605768
李霞等：口腔与肠道菌群联合揭示1型糖尿病血管并发症风险
Cardiovascular Diabetology——[10.6]
① 研究背景与设计：针对长病程1型糖尿病（T1D）血管并发症，本研究对75名患者（病程≥10年）及43名对照进行口腔/肠道宏基因组测序，结合代谢参数分析其与并发症的关联。② 核心发现与意义：研究揭示口腔-肠道微生态失调与T1D血管并发症显著相关，鉴定26种肠道（如Blautia wexlerae）及8种口腔（如奈瑟氏菌属）特异物种，证实双部位联合特征可显著提升预测效能。③ 微生物群结构差异：并发症组口腔/肠道α多样性显著降低，无并发症组富集特定产丁酸菌（如Roseburia inulinivorans）及口腔奈瑟氏菌属，提示其潜在血管保护作用。④ 代谢关联与中介作用：特定菌群丰度与糖化血红蛋白（HbA1c）、估计葡萄糖处理率（eGDR）显著相关，中介分析显示菌群可能部分介导代谢紊乱对并发症风险的影响。⑤ 口腔-肠道微生物交互：发现7种共享物种与并发症相关，两部位菌群在糖脂代谢存在相似功能扰动，支持口-肠轴交互可能参与并发症病理过程。⑥ 诊断模型性能：整合口腔/肠道特征的随机森林模型区分并发症表现优异（AUC 0.89-0.91），显著优于单一组分模型。⑦ 机制推测：推测产丁酸菌减少可能经由削弱抗炎或维生素K2合成影响血管，口腔奈瑟氏菌属减少或关联一氧化氮不足，提示微生态失调可能通过代谢-炎症轴促进并发症。
【原文信息】
Integrative oral and gut microbiome profiling highlights microbial correlates of complications in type 1 diabetes: a cross-sectional analysis
2025-12-24 , doi: 10.1186/s12933-025-03012-z
罗晓平/刘永锋等：牛犊腹泻潜在病原体鉴定与噬菌体疗法新靶点
Microbiome——[12.7]
① 研究背景与设计：针对新生牛犊腹泻（NCD）病因复杂的问题，本研究采集内蒙古12个农场的粪便样本，结合16S rRNA基因与宏基因组测序分析不同严重程度下的肠道微生态失调特征。② 核心发现与意义：研究鉴定了E. coli (bin.216) 和Streptococcus ruminantium (bin.338) 为关键潜在病原体，揭示了噬菌体与病原菌的协同作用及抗生素耐药基因的广泛流行。③ 微生物群落演替：腹泻严重组（L3-L5）微生物多样性显著降低，而健康组富集Bacteroides spp.和古菌Methanobrevibacter_A sp. 900313645，提示其在维持肠道稳态中的保护性作用。④ 病原菌毒力特征：E. coli (bin.216)携带33种毒力基因，特征性富集非典型铁摄取基因（如entABCDE和fepABCD），区别于传统肠毒素型菌株的致病机制。⑤ 新型致病菌鉴定：首次发现S. ruminantium (bin.338)在重症组显著富集，且携带sul3和tetB等耐药基因，其丰度与特定抗生素使用存在潜在关联。⑥ 病毒细菌互作：Escherichia phage VpaE1_ev108在重症组丰度最高，与E. coli (bin.216)呈现共现模式，提示病毒可能通过利用宿主资源辅助病原菌定植。⑦ 治疗策略展望：结果强调了耐药基因的环境传播风险，并提出利用噬菌体清除病原菌结合“细菌-古菌”益生菌移植的生态重构疗法，以替代传统抗生素治疗。
【原文信息】
Characterising gut microbiome dysbiosis in diarrhoea calves from multiple farms in Inner Mongolia using 16S and metagenomics
2025-12-29 , doi: 10.1186/s40168-025-02198-4
