番木瓜基因组组装和产量相关基因研究获新进展—新闻—科学网

广东省农业科学院果树研究所岭南特色果树研究团队在广东省自然科学基金面上项目等项目的资助下，在番木瓜基因组组装和产量相关基因研究方面取得新进展。近日，相关成果发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。

番木瓜是重要的热带和亚热带水果，但其遗传背景复杂，基因组虽小，但组装却不容易。而对番木瓜基因组，尤其是对主栽品种基因组的解析对于育种工作至关重要。

该研究中，研究人员对自主培育的番木瓜主栽品种紫晖进行了基因组组装，组装了一个大小为344.17Mb的高质量基因组，该基因组包含22250个基因。通过整合201个重测序的番木瓜基因组，鉴定出了四个不同的番木瓜类群，以及一个具有强烈驯化选择信号的基因组区域。进一步通过GWAS分析，在该区域内筛选到两个与番木瓜产量相关的候选基因：Cp_zihui06549（编码一种LRR-RLK蛋白）和Cp_zihui06768 （编码APO1蛋白），并利用异源表达对Cp_zihui06549进行了功能验证。

此外，研究人员构建了番木瓜泛基因组，基于基因存在-缺失变异（PAV）进行了选择分析，并将其与番木瓜的表达谱相结合进行基因保留分析。

该研究结果为了解番木瓜重要农艺性状和驯化过程相关基因提供了有价值的见解，为番木瓜育种工作奠定了坚实基础。

相关论文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhaf045

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