番木瓜畸形花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析

摘要：从海南乐东的感病番木瓜叶片上提取总RNA,用RT-PCR方法扩增番木瓜环斑病毒（PRSV）外壳蛋白基因组序列。测序结果显示,该环斑病毒外壳蛋白基因扩增片段长867个核苷酸。相似性分析表明,该核苷酸序列与GenBank中报道的47株PRSV和1株畸形花叶病毒核苷酸序列的相似性在62.41%～94.71%之间。运用CLUSTALX和MEGA软件绘制系统进化树,结果表明,番木瓜PRSV病毒大致可分为美洲-澳洲类群和东亚-东南亚类群2大类,后者又可分为SB1、SB2、SB3等3个亚类。乐东毒株和已报到的畸形花叶病毒PaMLV病毒都属于PRSV。不过乐东毒株属于SB1亚类,而PaMLV属于SB2亚类。乐东毒株（JQ318029）和另一海南毒株（HQ424465）属于SB1亚簇,信心指数分别达到89%、83%、96%。不过乐东毒株与越南北部的4种毒株（AF506875、FN808408、AJ875115、U14742）的同源性更高,说明导致乐东畸形花叶病的毒株可能来自越南,而不是由海南本地毒株变异而来。

关键词：番木瓜环斑病毒 畸形花叶病毒 外壳蛋白 相似性 系统发育树 

单位：中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室 海南海口571101 海南大学农学院 海南海口570228

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