“小柯”秀

　　《自然-遗传学》

　　同源重组缺失的晚期高级别浆液性卵巢癌多组学分析

　　澳大利亚墨尔本大学Elizabeth L. Christie研究团队完成同源重组缺失的晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSC）的多组学分析。相关成果近日发表于《自然-遗传学》。

　　研究人员表示，HGSC经常以同源重组（HR）DNA修复缺陷为特征，虽然大多数这样的肿瘤对初始治疗很敏感，但获得性耐药是常见的。

　　研究人员采取了一种多组学方法，利用从15名患有HR缺陷的HGSC妇女身上收集的多个尸检样本，来研究疾病末期的分子多样性。患者有多克隆疾病，在大多数患者中发现了几种抗性机制，包括逆转突变和通过其他方式恢复HR。研究人员还观察到频繁的全基因组重复和免疫成分的全面变化，并有证据表明免疫逃逸。这项分析突出了HGSC内部的各种演变，这些变化逃避了治疗，并最终压倒了个别患者。

　　相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41588-023-01320-2

　　遗传关联的网络扩展定义人类细胞生物学多效性图谱

　　英国欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）Pedro Beltrao团队近期取得进展，他们利用遗传关联的网络扩展定义了人类细胞生物学的多效性图谱。相关成果近日发表于《自然-遗传学》。

　　相互作用的蛋白质往往具有相似的功能，影响着相同的生物特性。相互作用网络可用于扩展全基因组关联研究中候选性状相关基因的列表。

　　研究人员对1002个人类特征进行了基于网络的特征相关基因扩增，表明这恢复了已知的疾病基因或药物靶点。网络扩展分数的相似性确定了可能共享潜在遗传和生物学过程的特征组。研究人员鉴定了73个与多种性状相关的多效性基因模块，这些模块富含参与蛋白质泛素化和RNA加工等过程的基因。与基因缺失研究相反，这里定义的多效性捕捉了多细胞相关过程。研究人员展示了与人类疾病相关模块的例子，这些模块富含具有已知致病性变异的基因，可用于绘制已批准药物的靶点，以便重新利用。

　　最后，研究人员阐述了如何使用网络扩展评分来研究炎症性肠病全基因组关联研究位点的基因，并将炎症性肠疾病相关基因与强大的功能和遗传支持联系起来。

　　相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41588-023-01327-9

　　《自然-方法学》

　　基于蓝藻色素的双向光诱导二聚体工程研究

　　加拿大多伦多大学G. Andrew Woolley、萨斯喀彻温大学Maruti Uppalapati和德国海涅大学Matias D. Zurbriggen共同合作，报道了基于蓝藻色素的双向光诱导二聚体（BICYCL）的工程研究。相关论文日前在线发表于《自然-方法学》。

　　用于控制蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的光遗传学工具已经从少数对有限波长选择作出响应的光传感器模块中开发出来。蓝藻色素GAF结构域变体对一系列不匹配的颜色作出反应，然而，它们的天然分子作用机制不易被用于PPI的光遗传学控制。

　　研究人员通过为红/绿GAF结构域设计合成的光依赖性相互作用体，开发了BICYCL。这种系统化的方法使未来工程的宽色系的蓝藻色素能够用于光遗传学。BICYCL是控制PPI的最小光遗传学工具之一，可实现绿色开/红色关（BICYCL红色）或红色开/绿色关（BICYCL绿色）控制，状态选择性高达800倍。对绿色波长的访问为现有工具的复用创造了新机会。

　　相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41592-023-01764-8

　　（原载于《中国科学报》 2023-03-09 第2版 国际）

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