水稻多效性基因Ghd7功能的分子机理解析
除Ghd7在拟南芥的功能鉴定因转基因植株不能繁殖而无法进行,Ghd7组织特异表达失败外,其他工作均顺利完成,同时还克隆了与Ghd7互作的基因Ghd8。共发表论文14篇。获得了Ghd7、Ehd1a、OsGI和Hd3a单基因的ZS97背景的近等基因系,杂交获得2个、3个及4个基因的聚合材料;
光照处理确定Ghd7在OsGI的下游,在Ehd1a和Hd3a的上游。另外还发现Ghd7和Ghd8存在互作,并克隆了重要适应性基因Ghd8。
Ghd8编码HAP3亚基,长日条件下抑制水稻开花。利用104份水稻品种进行Ghd7核酸多样性分析得到8种蛋白质类型,关联分析发现了一个位于启动子处的SNP,通过调节Ghd7表达量而影响水稻株高。
对180份材料的Ehd1、Hd1和Hd3a进行了深度测序,关联分析发现这些基因都有规律性的地理分布特点。
比较Ghd7纯合型、杂合型、缺失型、超表达和抑制表达植株的Ghd7基因表达量,发现随着表达量的增加,株高、开花期和每穗粒数表型都显著增加。
高低温处理试验证明Ghd7参与温度响应,且温度可以独立于光周期作用于Ghd7而影响抽穗期。
酵母双杂交系统筛选到11个与GHD7互作的HAP2和HAP5家族蛋白,其中有的HAP基因直接参与光周期途径。
获得了Ghd7基因融合3xFlag标签超表达植株,进行染色质免疫共沉淀和高通量测序分析,在高严谨度条件下发现96个结合位点。
ChIP-qPCR方法验证发现部分结合位点与Ghd7并不存在上下游调控关系。
用RNA-seq及基因芯片分析了近等基因系材料,鉴定出数个受Ghd7影响的开花途径基因、激素相关基因、生物与非生物逆境相关基因、花器官及株型基因。
验证了ABA和JA对Ghd7的抑制作用,鉴定出了Ghd7参与ABA、GA作用途径的基因。
比较NIL(mh7)和NIL(zs7)在不同种植密度下的分蘖情况,低密度条件下,NIL(mh7)的分蘖数要显著多于NIL(zs7),表明Ghd7正调控分蘖的形成。
低密度种植时,NIL(zs7)的一次枝梗和主穗长均减少,二次枝梗不变,穗粒数减少。而在NIL(mh7)中,低密度和高密度种植条件下,一次枝梗没有变化,而二次枝梗和主穗长均发生显著的增加和变长,穗粒数的增加。
因此,Ghd7主要是促进侧生器官的发育来调控植株形态发生。
相关知识
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