被子植物起源前后花发育相关基因和miRNA的进化研究

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摘要

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目录

第1章引言

1．1被子植物的起源与进化

1．2花起源相关的理论和假说

1．2．1植物变态理论

1．2．2真花学说

1．2．3假花学说

1．3花发育模型

1．3．1 ABC模型

1．3．2 ABCDE模型和四聚体模型

1．4植物miRNA

1．4．1 miRNA的生物合成

1．4．2植物新miRNA的起源

1．4．3 miRNA的作用机制

1．4．4植物miRNA的功能

1．4．5 miRNA靶基因的鉴定

1．5研究现状及问题

1．6研究内容和意义

第2章研究方法

2．1 数据收集

2．1．1植物基因组数据的搜集

2．1．2植物miRNA数据的搜集

2．1．3 花发育相关的基因和miRNA数据的搜集

2．2数据分析

2．2．1 基因家族的动态变化分析

2．2．2 miRNA家族的获得和丢失分析

2．2．4 miRNA和orhogroup进化历史分析

第3章结果与讨论

3．1 被子植物起源前后基因家族的变化

3．1．1基因家族构建

3．1．2多序列比对与系统发育分析

3．1．3基因家族动态变化分析

3．1．4被子植物祖先新获得的基因家族的功能富集分析

3．1．5花发育相关的基因家族的进化历史分析’

3．2被子植物起源前后miRNA家族的变化

3．3 被子植物起源前后miRNA与靶基因调控关系的变化

3．3．1 miRNA和靶基因调控关系的预测和筛选

3．3．2调控关系的进化历史分析

第4章结论与展望

4．1 结论

4．2展望

参考文献

附录

致谢

作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果

相关知识

被子植物花器官发育的分子机制
芦笋雌雄花发育转录组分析及性别决定相关miRNA靶基因的鉴定
miRNA研究服务案例1：毛白杨性别特异性花相关的miRNA及其靶基因 － 丁香通
北林安新民综述与年龄途径相关miRNA参与树木营养相变研究
植物所等在马兜铃基因组解析和被子植物进化研究中获进展
翠雀族植物复杂花发育和进化机制研究获进展—论文—科学网
被子植物开花时间和花器官发育的表观遗传调控研究进展
遗传发育所等揭示被子植物自交不亲和性起源、丢失和重获的高度动态进化机制
我校研究团队提出植物miRNA和抗病基因共演化模型
研究发现基因水平的趋同进化推动植物形态上的趋同进化

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