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芦笋雌雄花发育转录组分析及性别决定相关miRNA靶基因的鉴定

来源：花匠小妙招时间：2025-01-07 19:57

学位专题>浙江大学>芦笋雌雄花发育转录组分析及性别决定相关miRNA靶基因的鉴定

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摘要

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缩略词表

前言

1 文献综述

1．1 植物性染色体进化研究进展

1．1．1 植物性染色体的起源

1．1．2 植物性染色体的演变

1．1．3 遗传退化与剂量补偿效应

1．2 植物性别决定基因研究进展

1．2．1 植物性染色体连锁基因的挖掘

1．2．2 植物性别决定基因的分离与鉴定

1．3 miRNA参与调控植物性别决定与分化

1．3．1 植物miRNA的形成与作用机制

1．3．2 植物性别决定与分化相关的miRNA

1．4 激素与糖信号参与调控植物性别决定与分化

1．4．1 植物激素调控性别决定与分化

1．4．2 糖类代谢与植物性别分化

1．5 芦笋性别决定机制研究进展

1．5．1 芦笋雌雄花分化及其生理生化特性的研究

1．5．2 芦笋性别决定基因及其连锁分子标记的鉴定

1．6 转录组学研究概况

1．6．1 转录组测序技术

1．6．2 转录组学研究的应用

2 芦笋不同发育时期雌雄花形态学特征研究及转录组测序分析

2．1 材料与方法

2．1．1 植物材料

2．1．2 主要试剂与仪器

2．1．3 花器官的形态观察与比较

2．1．4 转录组的高通量测序

2．1．5 基因功能注释

2．1．6 差异表达基因筛选

2．1．7 SNP的鉴定

2．2 结果与分析

2．2．1 芦笋雌雄花发育的形态学特征与测序样品的选择

2．2．2 RNA-seq数据分析

2．2．3 芦笋雌雄花间差异表达基因分析

2．2．4 芦笋花发育不同时期间差异表达基因分析

2．2．5 芦笋雄花与雌花间SNP的鉴定

2．3 讨论

2．3．1 芦笋性别分化过程中两性花向单性花的转变

2．3．2 芦笋雌雄花发育过程中基因表达模式分析

2．3．3 基于表达特征预测芦笋性别决定相关基因

3 芦笋雌雄花不同发育时期差异表达基因的功能分析与验证

3．1 材料与方法

3．1．1 植物材料

3．1．2 主要试剂与仪器

3．1．3 差异表达基因的GO功能分类

3．1．4 差异表达基因的代谢通路预测

3．1．5 特定代谢途径相关基因的筛选

3．1．6 qRT-PCR验证基因表达特征

3．1．7 植物内源激素含量的测定

3．2 结果与分析

3．2．1 芦笋雌雄花间差异表达基因的GO功能富集分析

3．2．2 芦笋雌雄花间差异表达基因的Pathway富集分析

3．2．3 植物激素代谢相关基因的表达特征

3．2．4 糖类代谢相关基因的表达特征

3．2．5 基因表达模式的qRT-PCR验证

3．2．6 芦笋雌雄花不同发育时期内源生长素、赤霉素和茉莉酸的含量变化

3．3 讨论

3．3．1 植物激素调控芦笋性别决定与性别分化

3．3．2 糖信号参与调控芦笋性别分化

4 基于芦笋转录组数据对性别分化相关miRNA靶基因的鉴定与表达分析

4．1 材料与方法

4．1．1 植物材料

4．1．2 主要试剂与仪器

4．1．3 运用生物信息学方法预测miRNA靶基因

4．1．4 运用RLM-5’RACE法验证miRNA靶基因

4．1．5 miRNA及其靶基因的qRT-PCR分析

4．2 结果与分析

4．2．1 利用转录组数据库预测芦笋雌雄株差异表达miRNA的靶基因

4．2．2 运用RLM-5’RACE法验证得到芦笋4个miRNA的10个靶基因

4．2．3 芦笋雌雄花发育不同时期miRNA 及其靶基因的表达模式分析

4．3 讨论

4．3．1 芦笋雌雄个体差异表达miRNA的靶基因预测与验证

4．3．2 芦笋性别分化相关miRNA及其靶基因的筛选与鉴定

4．3．3 miR160d调控芦笋性别分化的模式浅析

5 结论

参考文献

附录

秦力

浙江大学

摘要：

植物性别决定是指雌、雄性器官产生差异并分离到不同个体形成具有单一性别特征个体的过程，性别决定模式具有不稳定性和遗传多样性的特点。在植物性别决定过程中，植物性染色体及其所承载的性别决定基因起主导作用，而microRNA(miRNA)可以通过调控性别决定基因的表达来影响植物的性别决定，此外，环境因素以及植物激素等外在和内在因素也会影响植物的性别表达。目前，涉及植物性别表达中基因调控网络的研究较少。芦笋(Asparagus offic…展开v

关键词：芦笋;雌花;雄花;性别分化;转录组差异;分子机理

授予单位：浙江大学

授予学位：硕士

学科专业：园艺学

导师姓名：卢钢

学位年度：2016

语种：中文

分类号：S644.9;S601

页数：136

在线出版日期：2016-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）