开花樱桃（Cerasus × yedoensis）栽培品种'染井吉野'中接近开花的花器官的转录组动力学,bioRxiv

深入了解开花樱桃（Cerasus × yedoensis）开花和花瓣运动的遗传机制)，我们对最受欢迎的开花樱桃品种“染井吉野”的花蕾和开放花进行了时间进程 RNA-seq 分析。从生长在日本三个不同地点的“染井吉野”树中收集了独立的花芽和开放花的生物重复样本。从当前研究（2019 年）和之前的研究（2017 年）中收集的花蕾和开放花样本中获得的 RNA-seq 读数与“染井吉野”的基因组序列进行比对，以量化基因转录水平。RNA-seq 读数的聚类分析揭示了转录组的动态变化，七个模块中的基因主要在特定时间点表达，范围从开花前 5 周到开花后 2 周。基于鉴定出的基因模块和在不同花期富集的基因本体论（GO）术语，我们推测樱桃花瓣运动和开花的遗传机制涉及发育、细胞壁组织、繁殖和代谢过程，它们是由编码转录因子、植物激素、转运蛋白和多糖代谢酶的基因执行。此外，我们提出了一种基于开花前不同时间点的基因表达水平作为 RNA 标记的樱桃开花预测方法。和多糖代谢酶。此外，我们提出了一种基于开花前不同时间点的基因表达水平作为 RNA 标记的樱桃开花预测方法。和多糖代谢酶。此外，我们提出了一种基于开花前不同时间点的基因表达水平作为 RNA 标记的樱桃开花预测方法。

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