果树所专家研究揭示非编码RNA在苹果不同组织中的表达特性

核心提示：近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队苹果资源课题组研究揭示非编码RNA在苹果根系、韧皮部、叶片、花和果实中的表达特性，揭示通过结合mdm-miR482可在苹果不同组织中具抗逆作用的多个lncRNA和circRNA，发现circRNA: Chr00:18744403|18744580通过与mdm-miR16相互作用可参与花器官的形态建成和着色；lncRNA：MSTRG.60895.2可作为mdm-miR393的模拟靶标调控MD17G1009000的表达，它可能在苹果果实的花青素代谢中具重要作

近日，中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队苹果资源课题组研究揭示非编码RNA在苹果根系、韧皮部、叶片、花和果实中的表达特性，揭示通过结合mdm-miR482可在苹果不同组织中具抗逆作用的多个lncRNA和circRNA，发现circRNA: Chr00:18744403|18744580通过与mdm-miR16相互作用可参与花器官的形态建成和着色；lncRNA：MSTRG.60895.2可作为mdm-miR393的模拟靶标调控MD17G1009000的表达，它可能在苹果果实的花青素代谢中具重要作用。相关成果发表在《基因（Genes）》和《国际分子科学（International Journal of Molecular Sciences）》上。

　　非编码RNA作为近年来的研究热点，可直接调控mRNA的表达，亦可通过结合miRNA进而调控mRNA的表达，在植物的形态建成、生物和非生物逆境中具重要的调控作用。

　　该研究从苹果5个主要组织中鉴定得到6495个circRNA和9440个lncRNA，获得不同组织中特异表达的lncRNA和circRNA，通过功能预测，miRNA靶位点预测等手段，获得特异表达lncRNA和circRNA在组织的特异表达特性和功能，以上结果为非编码RNA在苹果不同组织的功能解析奠定了基础。

　　原文标题：expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA

日期：2022-05-30

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