基于毛花猕猴桃基因组SSR的性别鉴定分子标记的筛选和通用性验证

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目录

第一章 综述

1.1 猕猴桃属概况

1.1.1 猕猴桃的起源与分布

1.1.2猕猴桃利用价值及栽培育种

1.1.3毛花猕猴桃概述及种植现状

1.2 植物性别研究现状

1.2.1植物性别的多态性及种类

1.2.2植物性别的决定机制

1.2.3 鉴定植物性别的研究方法

1.2.4 猕猴桃性别鉴定研究现状

1.3 微卫星分子标记

1.3.1 SSR的特点及分布

1.3.2 SSR的功能作用

1.3.3 SSR标记的种类

1.4 课题研究的目的意义和内容

1.4.1 课题研究的目的和意义

1.4.2 课题研究的内容

第二章 材料与方法

2.1 序列数据

2.2 实验材料与设备

2.2.1 植物材料

2.2.2 试剂材料

2.2.3 试剂盒

2.2.4 菌株与质粒

2.2.5 培养基

2.2.6 实验设备与仪器

2.2.7 引物序列

2.3 实验方法

2.3.1 毛花猕猴桃基因组数据的比较及SSR位点的识别定位

2.3.2 引物设计

2.3.3 猕猴桃基因组DNA的提取

2.3.4 PCR反应扩增

2.3.5 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测

2.3.6 DNA产物纯化

2.3.7 大肠杆菌感受态DH5α的制备方法

2.3.8 载体连接

2.3.9 大肠杆菌感受态转化

2.3.10 菌落鉴定

2.3.11 测序及序列比对

2.3.12 聚丙烯酰胺凝胶电泳

2.3.13 系统进化树的绘制

第三章 实验结果和分析

3.1 毛花猕猴桃SSR位点生物信息学分析

3.1.1 毛花猕猴桃基因组筛选的SSR位点数量与类型

3.1.2 毛花猕猴桃基因组筛选的SSR位点重复次数分布

3.1.3 毛花猕猴桃基因组筛选的SSR位点的分布特征

3.2.1 第一批引物筛选

3.2.2 第二批引物筛选

3.2.3 第三批引物筛选

3.3 特异性引物在毛花猕猴桃样本中的通用性验证

3.4 特异性片段的克隆与测序

3.4.1 Primer000181的测序比对

3.4.2 Primer003002的测序比对

3.4.3 Primer003002的进化树分析

3.4.4 Primer003072的测序比对

3.5猕猴桃性别标记的种间通用性验证

3.5.1 A001在猕猴桃种间的通用性验证

3.5.2 A002在猕猴桃种间的通用性验证

3.5.3 A003在猕猴桃种间的通用性验证

第四章 结论与讨论

4.1 结论

4.2 讨论

4.3 后期工作及展望

参考文献

攻读硕士学位期间的学术活动及成果情况

相关知识

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