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病毒最新研究进展20241018

来源：花匠小妙招时间：2024-11-29 12:53

本期美格导读为大家播报有关病毒的最新研究进展！

标题：Zika viruses encode 5’ upstream open reading frames affecting infection of human brain cells

译名：寨卡病毒编码影响人类脑细胞感染的5 '上游开放阅读框

作者：Charlotte Lefèvre等

时间：2024-10-12

期刊：Nature Communications

影响因子：14.7

DOI：10.1038/s41467-024-53085-9

摘要

寨卡病毒（ZIKV）是一种新兴的蚊媒黄病毒，与先天性神经系统并发症有关。该研究通过RNA测序和核糖体分析研究了典型寨卡病毒株中病毒基因表达的潜在病理相关性。除了在所有黄病毒中发现的单一长多聚蛋白外，还在基因组5'区发现了未被识别的上游开放阅读框（uORF）的翻译。在亚洲/美洲菌株中，核糖体翻译uORF1和uORF2，而在非洲菌株中，这两种uORF融合为一个（非洲uORF）。本研究使用反向遗传学来检测不同的uORFs突变病毒对寨卡病毒适应度的影响。发现非洲的uORF和亚洲/美洲的uORF1的表达调节病毒在人类皮质神经元和脑类器官中的生长和趋向性，这表明在嗜神经性中有潜在的作用。虽然uORF在蚊子细胞中表达，但没有看到蚊子媒介在体内传播的可测量影响。寨卡病毒uORF的发现为这种病毒感染人类脑细胞提供了新的思路，并提出了它们是否存在于其他嗜神经黄病毒中的问题。

推荐语

本文作者确定了寨卡病毒亚洲/美洲谱系中的上游开放阅读框（uORFs）、uORF1和uORF2 以及非洲谱系中的非洲uORF，并且鉴定出的uORF影响神经细胞中的病毒复制。

标题：Conservation of molecular responses upon viral infection in the non-vascular plantMarchantia polymorpha

译名：非维管植物Marchantia polymorpha对病毒感染的分子反应的保守性

作者：Eric Ros-Moner等

时间：2024-09-27

期刊：Nature Communications

影响因子：14.7

DOI：10.1038/s41467-024-52610-0

摘要

大约4.5亿年前，植物从水过渡到陆地后，它们面临着新的致病微生物。它们在不同栖息地的定植是由根系、气孔和维管组织等解剖学上的创新驱动的，这些创新成为植物与微生物相互作用的核心。然而，这些创新对植物免疫和病原体感染策略的影响仍然知之甚少。该研究探索植物-病毒在苔藓植物Marchantia polymorpha中的相互作用，以深入了解这些关系的进化。病毒组分析显示，Marchantia主要与RNA病毒相关。与烟草花叶病毒（TMV）的比较研究表明，Marchantia与维管植物具有相同的核心防御反应，但也表现出独特的特征，例如持续的伤口反应，防止病毒传播。此外，Marchantia的一般防御反应与烟草中的维管组织相同，这表明进化获得的发育创新导致了维管植物防御反应的重新定向。

推荐语

对植物-病毒相互作用进化的评估表明，陆地定植后植物病毒组的快速重塑，以及对新获得的维管组织的一般防御反应的重新定向，这些维管组织成为病毒感染的焦点。

标题：Large expansion of plasma commensal viruses is associated with SIV pathogenesis inMacaca leonina

译名：猕猴SIV的发病机制与血浆共生病毒的大量扩增有关

作者：Yanpeng Li等

时间：2024-10-02

期刊：Science Advances

影响因子：11.7

DOI：10.1126/sciadv.adq1152

摘要

人类免疫缺陷病毒-1（HIV-1）感染破坏了宿主和共生微生物之间的稳态平衡。然而，血浆共生病毒的动态变化及其在HIV/猴免疫缺陷病毒（SIV）发病中的作用却鲜有报道。研究使用SIV感染的Macaca leonina模型研究了血浆病毒组、炎症水平和疾病标志物的纵向变化。自SIV感染的慢性期以来，观察到血浆Anelloviridae、Parvoviridae、Circoviridae和其他共生病毒大量扩增，炎症和D -二聚体水平升高。Anelloviridae的丰度似乎与CD4+ T细胞计数呈正相关，但与SIV载量呈负相关，尤其是在急性期，而其他共生病毒的丰度与这两种疾病标志物呈相反的相关性。抗逆转录病毒治疗可轻微减少但不能完全逆转共生病毒的扩张。此外，还对1387个灵长类猿类病毒开放阅读框1序列的1500多个核苷酸进行了注释。这些数据揭示了共生病毒在SIV发病机制中的不同作用。

推荐语

研究报道了由SIV感染引起的血浆Anelloviridae以及其他共生病毒（如Parvoviridae和Circoviridae）的大量扩增，并显示了这些共生病毒在SIV发病机制中的不同作用。数据揭示了SIV、血浆共生病毒和宿主在整个SIV感染和随后的ART过程中的复杂相互作用。

标题：Structures of the Foamy virus fusion protein reveal an unexpected link with the F protein of paramyxo- and pneumoviruses

译名：泡沫状病毒融合蛋白的结构揭示了与副腮腺炎病毒和肺炎病毒F蛋白的意想不到的联系

作者：Ignacio Fernández等

时间：2024-10-11

期刊：Science Advances

影响因子：11.7

DOI：10.1126/sciadv.ado7035

摘要

泡沫病毒（FV）是逆转录病毒的一个亚科。它们的包膜（Env）糖蛋白在进入细胞期间驱动病毒膜和细胞膜的合并。目前仅有的逆转录病毒Envs结构来自正逆转录病毒亚科的人类和猿类免疫缺陷病毒，它们与FV仅远亲。研究报道了融合前和融合后状态下FV Env胞外域的冷冻电子显微镜结构，这出乎意料地证明了与副粘病毒和肺病毒的融合蛋白（F）的结构相似性，这意味着病毒融合原之间的进化联系。作者描述了FV Env独有的结构特征，并提出了其构象变化的机理模型，强调了其结构元件的相互作用如何驱动膜融合和病毒进入。FV Env 的结构知识现在为功能研究提供了一个框架，这有利于FV Env变体的设计，具有改进的特征，可用作基因治疗载体。

推荐语

该研究表明，FV Env在结构上与其他不相关的副粘病毒和肺炎病毒的融合（F）蛋白相似，值得注意的是，在分隔N-SU和C-SU的呋喃位点上游插入了一个RBD。通过比较FV Env融合前和融合后的两种构象，可以描述该蛋白驱动膜合并的功能转变，从而揭示这种古老融合剂的作用机制。

标题：Inherent symmetry and flexibility in hepatitis B virus subviral particles

译名：乙型肝炎病毒亚病毒颗粒的固有对称性和灵活性

作者：Quan Wang等时间：2024-09-12

期刊：Science

影响因子：44.7

DOI：10.1126/science.adp1453

摘要

慢性乙型肝炎病毒（HBV）感染是全球健康面临的一大挑战，发病率和死亡率都很高。尽管有预防性疫苗，但目前的治疗方法只能有限地清除病毒，因此需要终生治疗。HBV表面抗原（HBsAg）是诊断和预后的关键，但其高分辨率结构和在病毒包膜上的组装仍然难以捉摸。利用广泛的数据集和先进的冷冻电镜分析，研究以3.7埃的近原子分辨率揭示了HBsAg的结构。HBsAg同源二聚体组装成具有D2-和D4-类准对称性的亚病毒颗粒，阐明了HBsAg的致密堆积规则和结构适应性。这些发现为了解HBsAg如何组装成高阶丝状物并与囊膜相互作用形成病毒提供了见解。

推荐语

乙型肝炎病毒是通过包被有蛋白表面抗原HBsAg的脂膜病毒传播的。这种蛋白质的结构及其如何组装成各种形状和大小的颗粒一直不为人知，而蛋白质包膜的异质性和灵活性又使这一问题变得更加复杂。作者等人分离出两类球形颗粒，分别含有40和48个拷贝的HBsAg二聚体，通过冷冻电镜确定了一种三聚体和三种不同的四聚体局部组装模式。HBsAg和一些已确定的亚装配具有高度灵活性，这可能解释了为什么单个二聚体可以产生如此多不同的寡聚形式。根据观察到的组装规则，作者推测球形结构可能会扩展成众所周知的、更大的管状结构。

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