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CGD:用于菊花基因组和生物学研究的多组学数据库,Horticulture Research

来源:花匠小妙招 时间:2024-11-23 11:42

CGD:用于菊花基因组和生物学研究的多组学数据库
Horticulture Research ( IF 7.6 ) Pub Date : 2024-08-22 , DOI: 10.1093/hr/uhae238
Jingxuan Ye 1, 2 , Chun Wang 1, 2 , Ye Liu 1, 2 , Shaocong Chen 1, 2 , Jinyu Jin 1, 2 , Lingling Zhang 1, 2 , Peixue Liu 1, 2 , Jing Tang 1, 2 , Jing Zhang 1, 2 , Zhenxing Wang 1, 2 , Jiafu Jiang 1, 2 , Su-Mei Chen 1, 2 , Fadi Chen 1, 2 , Aiping Song 1, 2



菊科是最大的双子叶植物科,包括菊花和向日葵,这两个重要的观赏植物属。菊花属由 30 多个物种组成,包含许多具有重要经济意义的观赏、药用和工业植物。为了更有效地促进菊花研究,我们构建了 CGD,这是一个包含大量数据和有用工具的菊花基因组数据库。CGD 包含 6 种菊花物种的精心组装的参考基因组数据。通过与各种蛋白质和结构域数据进行比较,这些基因组数据得到了充分的注释。随后将 9 个不同组织、5 个花发育阶段和 5 个处理的转录组数据添加到 CGD 中。设计了一个功能齐全的“RNA data”模块,以提供完整和可视化的表达谱数据。此外,CGD 还提供了许多最新的生物信息学分析工具,例如高效的菊花 sgRNA 搜索工具。综上所述,CGD 为菊花提供了最新、最丰富、最完整的多组学资源和强大的工具。总的来说,CGD 将成为菊花基因组学和遗传育种研究的中心门户,并将有助于多倍体进化的研究。

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更新日期:2024-08-22

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所属分类:花卉
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