菜豆几丁质酶基因的克隆,序列分析及其表达.PDF文档全文免费阅读、在线看
第26卷 第2期 大 豆 科 学 Vol.26 No.2 2007年 4月 SOYBEANSCIENCE Apr. 2007 菜豆几丁质酶基因的克隆、序列分析及其表达 1,2 2 2 曲 敏 ,王全伟 ,李新玲 (1.哈尔滨商业大学食品工程学院生物系,哈尔滨 150076;2.哈尔滨师范大学生命与环境科学学院,哈尔滨 150080) 摘要 根据GenBank中收录的菜豆几丁质酶基因mRNA序列设计一对引物,以菜豆品种五常油豆 总DNA为模板,通过PCR扩增获得一个约1.1kb的DNA片段Bchi,将其克隆入pUC18载体。测 序和序列分析结果表明,该序列全长1088bp,含有一个981bp的完整开放读码框,无内含子,编码 327个氨基酸,编码产物在结构上具有ClassIa几丁质酶的结构特征:N-端具有一个26个氨基酸 的信号肽,其后是富含8个半胱氨酸、长41个氨基酸的几丁质结合区和由249个氨基酸组成的高 度保守的催化区,C-端为由11个氨基酸组成的液泡定位多肽。序列与结构上的同源性分析表明 Bchi基因是菜豆ClassIa几丁质酶基因。此序列已在 GenBank中注册,登录号为AY357300。以 pQE-30为原核表达载体,构建成pQE-Bchi重组表达载体,转化表达受体菌E.coliM15,经IPTG 诱导后表达出一个约35kD的蛋白,与推测的Bchi基因编码产物的大小一致,表明Bchi基因在大肠 杆菌中能够表达,是一个具有表达功能的基因。 关键词 菜豆;几丁质酶基因;克隆;序列分析;表达 中图分类号 S565.1 文献标识码 A 文章编号 1000-9841(2007)02-0121-06 CLONING,SEQUENCINGANDEXPRESSIONOFCHITINASEGENEFROMKIDNEYBEAN 1,2 2 2 QUMin ,WANGQuanwei,LIXinling (1.BiologyDepartmentofFoodEngineeringCollege,HaerbinUniversityofCommerce,Haerbin,150076;2.LifeSci enceandEnvironmentScienceInstitute,HarbinNormalUniversity,Harbin150080) Abstract Inthisstudy,wedesignedpairofprimers,whichbasedonthemRNAsequencesofchitinase geneofbeancollectedinGenBank,toamplifythisgeneinthegenomeofWuchangbeanbyPCR.Wegot aDNAfragmentofabout1.1kb,whichwasnamedBchi,thenweclonedthisDNAfragmentinpUC18 vector.Bysequencing,wefoundthatthisfragmentwas1088bpandhadaORFof981bp,whichhadno introns.Thissequenceencoded327aminoacids,whoseproducthadthestructuretraitofClassIachiti nase:Therewasasignalpeptideof26aminoacidsontheNendfollowedbychitin-bindingdomainof 41aminoacidsandhighlyconservativecatalyticregionof249aminoacid;ontheCend,therewasVTP of11aminoacids.ThehomogeneityinstructureandsequenceshowedthatthisDNAfragmentwasthe geneofClassIachitinaseofbean,whichwasregisteredinGenBank,theaccessionnumb
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