向日葵多头基因分子标记的开发及抗菌核病基因资源的挖掘
向日葵多头基因分子标记的开发及抗菌核病基因资源的挖掘
【摘要】: 向日葵作为世界四大油料作物之一,具有较强的杂种优势。由于多头向日葵植株花期较长,杂交种生产上常用优良的多头材料做父本,克服了父母本花期不育的问题,显著提高了杂交种的制种产量。对向日葵多头基因进行定位,可以为优良多头恢复系亲本的快速选育提供可靠的分子标记,加速恢复系的培育,节约了大量的时间和人力物力。同时,可以为该基因的图位克隆打下良好的基础。筛选和鉴定不同来源土壤中对向日葵菌核病具有较强拮抗能力的拮抗菌株,可用于分离拮抗物质及克隆相关抗性基因,挖掘菌核病的异源抗病基因资源,同时,丰富了在生产上具有应用潜力的生防菌菌种资源。本篇论文做了大量的工作,包括多头基因的遗传模式分析、定位群体构建、向日葵多头基因的初步定位、多态性标记的开发,核盘菌的培养、土壤微生物的分离、拮抗菌株的筛选、拮抗菌株的鉴定等。得到了以下结论:(1)向日葵F2群体中单头向日葵与多头向日葵的比例为3:1,证明向日葵遗传模式是单隐性基因控制。筛选多态性标记,将b1定位在SSR标记ORS1088和ORS908之间,其遗传距离为10.5 cM和20.1 cM。(2)在上述定位区间内选择42对SNP序列,在NCBI中找到其对应的EST序列,设计引物扩增,分析序列信息开发出了两个多态性标记IP5357和IP2874,在F2群体中检测与b1共分离。(3)用MDA、PDA培养基培养采集到的核盘菌菌核,培养1d、2d、5d、8d分别统计其菌落直径和形成菌核数量,结果表明,PDA培养基培养核盘菌菌丝生长速度比MDA培养基快,MDA培养基培养核盘菌菌丝形成菌核的数量比PDA培养基多。(4)从采集到的4个土壤样品中共分离到微生物单株26株,经过筛选,获得3株对核盘菌具有较好拮抗效果的细菌菌株,分别命名为BMD1,BMD2,BMD3。其中BMD3的拮抗效果最好,其抑菌直径为5.7 mm,具有较好的应用前景。通过16S rDNA序列对比和系统发育树分析,结果表明,BMD1与芽孢杆菌Bacillus subtilis(X60646)亲缘关系较近,序列相似度高于99%;BMD2与BMD3有两个碱基差异,二者同芽孢杆菌Bacillus pumilus(AB098578)、芽孢杆菌Bacillus altitudinis(AJ831842)、芽孢杆菌Bacillus stratosphericus(AJ831841)和芽孢杆菌Bacillus aerophilus(AJ831844)处于系统发育树同一分枝。
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
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