生物杀虫剂创新团队完成白星花金龟基因组序列解析
近日,中国农科院植保所生物杀虫剂创制与应用创新团队围绕白星花金龟( Protaetiabrevitarsis )研究与利用取得可喜进展,在Gigascience(五年IF 10.742)上发表了题为“ De novo genome assembly of the white-spotted flower chafer ( Protaetiabrevitarsis )”的研究论文,首次报道了白星花金龟基因组特性。基因组拼接结果显示白星花金龟单套染色体为750.74 Mb (包括327个scaffolds,N50为2.94 Mb),此外,拼接完成的基因组还包括393.19 Mb的等位片段。该基因组编码34,110个基因,其中单套染色体编码22,229个基因,等位片段编码11,881个基因。进化分析结果显示,其与食粪金龟 Onthophagustaurus 最为接近,两者大约在1.4亿年前发生分化(图1)。
白星花金龟属鞘翅目金龟甲科,是一种重要的农业昆虫,广泛分布于中国及周边国家,自然环境中每年发生一代。白星花金龟幼虫为腐食性,主要取食腐烂的植物残体、畜禽粪便等废弃物,不为害植物,是一种重要的废弃物分解者。该团队今年1月份在Waste Management(五年IF 5.262)发表的研究论文指出,白星花金龟幼虫转化废弃物不仅速度快,而且效率高,其转化玉米秸秆所获得的虫粪腐殖酸含量为24.37%,远高于其他转化技术。然而,白星花金龟成虫为植食性,为害包括玉米、葵花等作物,葡萄、梨等果树的花和果实,对农业生产影响较大,是一种重要的农业害虫。白星花金龟基因组的测定完成,对于进一步揭示金龟甲科昆虫食性适应性进化机制、加强此类害虫防治以及进一步综合开发利用,均具有重要的理论意义和应用价值。
白星花金龟基因组测序研究由中国农科院植物保护研究所束长龙副研究员发起并主持,由中国农科院植物保护研究所、北京赛默百合生物科技有限公司及沧州市农林科学院等3家单位共同完成,中国农业科学院植物保护研究所为第一完成单位,博士研究生王奎为该论文的第一作者,束长龙副研究为通讯作者。该研究得到国家重点研发计划(2018YFD0800906与2017YFD0201204)、中国农科院基本业务费、创新工程、以及成果培育计划资助。
文章1链接:https://academic.oup.com/gigascience/article/8/4/giz019/5428098
文章2链接:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0956-053X(18)30673-1
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