来自两个兰花物种的 R2R3

来自两个兰花物种的 R2R3-MYB 转录因子基因的全基因组鉴定和表达分析
PeerJ ( IF 2.3 ) Pub Date : 2020-09-01 , DOI: 10.7717/peerj.9781
Honghong Fan 1 , Manli Cui 1 , Ninghong Li 1 , Xujuan Li 1 , Yuxuan Liang 2 , Lin Liu 1 , Yongping Cai 1 , Yi Lin 1

MYB 转录因子在植物生长、发育和逆境响应的不同植物生物学过程中发挥重要作用。在本研究中，分别在铁皮石斛和蝴蝶兰的基因组中鉴定了 101 个 (DoMYB1-101) 和 99 个 (PaMYB1-99) R2R3-MYB 基因。为了对分离的候选基因进行分类，选择了拟南芥的 R2R3-MYB 基因作为参考。结果，所有鉴定出的 DoMYB 和 PaMYB 基因被分为 22 个亚家族。系统发育分析表明，S21 在所有亚科中成员数量最多。所有已鉴定基因的内含子、外显子和保守序列的数量都不同。此外，选择了来自六个亚家族的 20 个 DoMYB 基因，用于进一步分析组织特异性表达和对各种非生物胁迫处理的反应。结果表明，S4 和 S19 亚科中的所有 DoMYB 基因在花中均表现出最高的相对表达水平。DoMYB31、DoMYB40、DoMYB49、DoMYB52和DoMYB54等5个DoMYB基因对应激反应作出反应。这些结果可能为进一步研究 R2R3-MYB 基因家族提供有用的信息。

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更新日期：2020-09-01

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