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用于预防或减少真菌病原体在植物上生长的微生物组合物

来源：花匠小妙招时间：2024-10-18 19:23

摘要：本文公开了针对植物真菌病原体的生物防治组合物及其用于预防或减少作物损失或食物腐败的方法。所述生物防治组合物可以包括具有抗真菌活性的至少一种微生物或所述至少一种微生物的次级代谢产物。所述方法可以包括向植物、种子或其农产品或者向用于运输或储存所述农产品的包装材料施用所述生物防治组合物。

权利要求：

1.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体；其中所述至少一种微生物具有与选自SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:9的组的16S rRNA序列呈大于99％同一性的16S rRNA序列，或者其中所述至少一种微生物具有与选自SEQ IDNO:17和SEQ ID NO:20的组的ITS序列呈大于99％同一性的ITS序列，或者其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:18的ITS序列呈大于90％同一性的ITS序列。 2.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体；其中所述至少一种微生物包含与大于200碱基的序列呈大于99％同一性的rRNA序列，所述序列包含选自SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:9的rRNA序列，或者其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:17的ITS序列呈大于99％同一性的ITS序列，或者其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:18呈大于90％同一性的ITS序列。 3.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中如通过分别测量尖孢镰刀菌或大丽轮枝菌的存活所测定的，所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制尖孢镰刀菌的生长25％或更多，或相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制大丽轮枝菌的生长60％或更多。 4.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:22的16S rRNA序列呈大于99％同一性的16S rRNA序列。 5.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述至少一种微生物具有与选自SEQ ID NO:23的组的16S rRNA序列呈大于99％同一性的16S rRNA序列。 6.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:24的16S rRNA序列呈大于99％同一性的16S rRNA序列，或者其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:25的ITS序列呈大于99％同一性的ITS序列，或者其中所述至少一种微生物具有与SEQ ID NO:25的ITS序列呈大于90％同一性的ITS序列。 7.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制灰葡萄孢的生长25％或更多。 8.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制蓝莓干枯病菌的生长25％或更多。 9.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制白蜡树炭疽菌的生长25％或更多。 10.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制高粱柄锈菌的生长25％或更多。 11.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制葡萄生轴霜霉的生长25％或更多。 12.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制葡萄白粉菌的生长25％或更多。 13.一种生物防治组合物，包括： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制Podasphaera macularis的生长25％或更多。 14.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制Pytium属的生物体的生长25％或更多。 15.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物，以及 (ii)载体，其中所述生物防治组合物能够相对于未暴露于所述生物防治组合物的对照抑制根霉菌属的生物体的生长25％或更多。 16.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物的次级代谢产物，以及 (ii)载体；其中所述至少一种微生物具有与选自SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:25的组的ITS序列呈大于99％同一性的ITS序列。 17.一种生物防治组合物，其包含： (i)至少一种微生物的一种或多种次级代谢产物，以及 (ii)载体；其中所述至少一种微生物具有与选自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:22、SEQID NO:23和SEQ ID NO:24的组的16S rRNA序列呈大于99％同一性的16S rRNA序列。 18.如权利要求1-17中任一项所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物经分离和纯化。 19.如权利要求1-17中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物还包含第二微生物，其中所述第二微生物与所述至少一种微生物不相同。 20.如权利要求19所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物经分离和纯化。 21.如权利要求18或20所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含与选自SEQID NO:1-25的序列呈至少95％同一性的RNA序列。 22.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含与选自SEQ IDNO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、22、23和24的16S rRNA序列呈至少95％同一性的16S rRNA序列。 23.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含与选自SEQ IDNO:17、18、19、20、21和25的ITS序列呈至少95％同一性的内转录间隔区(ITS)序列。 24.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含与选自SEQ IDNO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、22、23和24的16S rRNA序列呈至少99％同一性的16S rRNA序列。 25.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含与选自SEQ IDNO:17、18、19、20、21和25的ITS序列呈至少99％同一性的内转录间隔区(ITS)序列。 26.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含16S rRNA序列，所述16S rRNA序列是选自SEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、22、23和24的16S rRNA序列。 27.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述第二微生物包含内转录间隔区(ITS)序列，所述内转录间隔区(ITS)序列是选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21和25的ITS序列。 28.如权利要求21所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物包含与SEQ IDNO:24呈至少99％同一性的16S rRNA序列，并且所述第二微生物包含与SEQ ID:NO 25呈至少99％同一性的ITS序列。 29.如权利要求21-27中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物包含第三微生物，并且所述第三微生物与所述第二微生物或所述至少一种微生物均不相同。 30.如权利要求29所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物包含第四微生物，并且所述第四微生物与所述第三微生物、所述第二微生物或所述至少一种微生物中的任何一个均不相同。 31.如权利要求30所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物包含第五微生物，并且所述第五微生物与所述第四微生物、所述第三微生物、所述第二微生物或所述至少一种微生物中的任何一个均不相同。 32.如权利要求29所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物包含与SEQ ID:23呈大于99％同一性的16S rRNA序列，所述第二微生物包含与SEQ ID:23呈大于99％同一性的16S rRNA序列，并且所述第三微生物包含与SEQ ID:23呈大于99％同一性的16S rRNA序列。 33.如权利要求18所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物具有与SEQ IDNO:25呈大于90％同一性的ITS序列，并且其中所述第二微生物是葡糖杆菌属种。 34.如权利要求33所述的生物组合物，其中所述葡糖杆菌属种是葡萄糖杆菌。 35.如权利要求33所述的生物组合物，其中所述葡萄糖杆菌具有与SEQ ID NO:24呈大于99％同一性的16S rRNA序列。 36.如权利要求18所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物具有与SEQ IDNO:18呈大于90％同一性的ITS序列，并且其中所述第二微生物是葡糖醋杆菌属种。 37.如权利要求35所述的生物防治组合物，其中所述葡糖醋杆菌种是产液葡糖醋杆菌。 38.如权利要求35所述的生物防治组合物，其中所述葡糖醋杆菌种具有选自SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ IDNO:14和SEQ ID NO:16的16S rRNA序列。 39.如权利要求16或17所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物的所述次级代谢产物是从所述至少一种微生物的培养物的上清液中分离出来的。 40.如权利要求16或17所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物的所述一种或多种次级代谢产物包含脂肽。 41.如权利要求40所述的生物防治组合物，其中所述脂肽是选自表面活性素、丰原素和伊枯草菌素的环脂肽。 42.如权利要求16或17所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物的所述一种或多种次级代谢产物包含聚酮。 43.如权利要求16或17所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物的所述一种或多种次级代谢产物包含挥发性抗真菌化合物。 44.如权利要求3-15中任一项所述的生物防治组合物，其中所述对照暴露于枯草芽孢杆菌菌株QST 713。 45.如权利要求1-15中任一项所述的生物防治组合物，其中所述至少一种微生物经分离和纯化。 46.如权利要求1-45中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物是液体或粉末。 47.如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物包含营养细胞。 48.如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物包含孢子。 49.一种预防或减少真菌病原体在植物、种子或其农产品上生长的方法，包括：向所述植物、所述种子、所述花或所述产品施用如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物具有抗真菌活性。 50.一种预防或减少真菌病原体在植物、种子、花或其农产品上生长的方法，包括：向土壤施用如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物具有抗真菌活性。 51.一种预防或减少真菌病原体在农产品上生长的方法，包括：向用于运输或储存所述农产品的包装材料施用如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物，其中所述生物防治组合物具有抗真菌活性。 52.一种预防或减少真菌病原体在种子或农产品上生长的方法，包括：将如权利要求1-46中任一项所述的生物防治组合物结合到选自以下的过程中：清洗所述农产品或所述种子、涂覆所述农产品或所述种子及其组合。 53.如权利要求49-52中任一项所述的方法，其中所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是杜鹃花科的植物、种子、花或其农产品。 54.如权利要求53所述的方法，其中所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是杜鹃花科越橘属的植物、种子、花或其农产品。 55.如权利要求54所述的方法，其中所述越橘属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是蓝莓。 56.如权利要求49-52中任一项所述的方法，其中所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是葡萄科的植物、种子、花或其农产品。 57.如权利要求56所述的方法，其中所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是葡萄科葡萄属的植物、种子、花或其农产品。 58.如权利要求57所述的方法，其中所述葡萄属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是葡萄。 59.如权利要求49-52中任一项所述的方法，其中所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是蔷薇科的植物、种子或其农产品。 60.如权利要求59所述的方法，其中所述蔷薇科的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是悬钩子属、苹果属、梨属、榅桲属、李属、蔷薇属或草莓属。 61.如权利要求60所述的方法，其中所述悬钩子属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是覆盆子或黑莓。 62.如权利要求60所述的方法，其中所述草莓属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是草莓。 63.如权利要求60所述的方法，其中所述梨属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是梨。 64.如权利要求60所述的方法，其中所述榅桲属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是榅桲。 65.如权利要求60所述的方法，其中所述李属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是扁桃、桃、李子、杏、樱桃或黑刺李。 66.如权利要求60所述的方法，其中所述蔷薇属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是玫瑰。 67.如权利要求60所述的方法，其中所述苹果属的所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品是苹果。 68.如权利要求49所述的方法，其中施用所述生物防治组合物包括使用所述生物防治组合物撒粉、浸渍、滚动、注入、擦抹、喷涂或刷涂所述植物、所述种子、所述花或所述农产品。 69.如权利要求49所述的方法，其中向所述植物施用所述生物防治组合物包括将所述生物防治组合物添加至滴线、灌溉系统、化学灌溉系统、喷雾剂或浸剂。 70.如权利要求49所述的方法，其中向所述植物施用所述生物防治组合物包括向所述植物的根施用所述生物防治组合物。 71.如权利要求70所述的方法，其中向所述根的所述施用是间接的。 72.如权利要求49所述的方法，其中在将所述农产品从所述植物移除之后向所述农产品施用所述生物防治组合物。 73.如权利要求49所述的方法，其中所述施用不会杀死所述植物。 74.如权利要求49所述的方法，还包括向所述植物施用肥料、除草剂、农药、另一生物防治组合物或其组合。 75.如权利要求49所述的方法，其中所述肥料、除草剂、农药或另一生物防治组合物在所述生物防治组合物之前、在所述生物防治组合物之后或者与所述生物防治组合物同时施用。 76.如权利要求51所述的方法，其中所述包装材料包括：聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)、模塑纤维、定向聚苯乙烯(OPS)、聚苯乙烯(PS)泡沫、聚丙烯(PP)或其组合。 77.如权利要求51所述的方法，其中向包装材料的施用包括清洗或浸渍所述包装材料。 78.如权利要求-中任一项所述的方法，其中所述抗真菌活性阻止所述真菌病原体生长至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20天。 79.如权利要求49-52中任一项所述的方法，其中所述抗真菌活性是相对于所述真菌病原体在对照上的生长，所述真菌病原体在所述植物、所述种子、所述花或所述其农产品上减少的生长，所述对照是未暴露于所述生物防治组合物的蔷薇科植物或其农产品。 80.如权利要求79所述的方法，其中在所述真菌病原体暴露于所述生物防治组合物之后，所述真菌病原体的所述生长相对于所述真菌病原体在未暴露于所述生物防治组合物的植物、种子、花或其农产品上的生长减少至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20天。 81.如权利要求49-52中任一项所述的方法，其中所述生物防治组合物具有针对丝状或非丝状真菌病原体的抗真菌活性。 82.如权利要求所述的方法，其中所述丝状或非丝状真菌病原体选自：白锈菌、西方白锈、烟草赤星病菌、瓜链格孢、胡萝卜链格孢、茄链格孢、细链格孢、细极链格孢、番茄链格孢、根腐丝囊霉、萝卜丝囊霉、蜜环菌、Botrydia theobromae、灰葡萄孢、富克葡萄孢盘菌、莴苣盘霜霉、甜菜生尾孢、黑莓小尾孢、多主枝孢、尖孢炭疽菌、胶孢炭疽菌、菜豆炭疽菌、香蕉炭疽菌、白蜡树炭疽菌、香蕉暗双孢、多主棒孢、葡萄根瘤蚜、泻根亚隔孢壳、痂囊腔菌、芒果痂囊腔菌、覆盆子痂囊腔菌、菊科白粉菌、葡萄白粉菌、葡萄藤猝倒病菌、禾谷镰刀菌、尖孢镰刀菌、茄镰刀菌、狭长孢灵芝、葡萄球座菌、悬钩子裸双孢锈菌、茄长蠕孢、盾壳霉小球腔菌、油菜小球腔菌、鞑靼内丝白粉菌、菜豆壳球孢、桤叉丝壳、果产链核盘菌、蓝莓干枯病菌、角球腔菌、芸苔球腔菌、草莓球腔菌、斐济球腔菌、鞑靼拟粉孢、黄钉孢、霜霉菌、粉霜霉、短小茎点霉、昏暗拟茎点霉、牛痘拟茎点霉、葡萄拟茎点霉、辣椒疫霉、红腐疫霉、致病疫霉、寄生疫霉、葡萄生轴霜霉、甘蓝根肿菌、斑点单囊壳、马铃薯皮斑病菌、葡萄假尾孢、葱柄锈菌、高粱柄锈菌、牛痘膨痂锈菌、德巴利腐霉、腐霉沟、终极腐霉、茄科雷尔氏菌、厚环柱隔孢、茄丝核菌、少根根霉、匍枝根霉、小核盘菌、核盘菌、白腐小核菌、齐整小核菌、小核盘菌、核盘菌、芹菜生壳针孢、莴苣壳针孢、番茄壳针孢、欧芹壳针孢、鳄梨痂圆孢、斑点单囊壳、马铃薯粉痂菌、囊状匍柄霉、内生瓶菌、根串珠霉、葡萄钩丝壳、疣顶单孢锈菌、蓼单孢锈菌、黑白轮枝菌、大丽轮枝菌、可可轮枝菌及其任何组合。 83.如权利要求所述81的方法，其中所述丝状真菌病原体选自由以下组成的组：尖孢镰刀菌、大丽轮枝菌、灰葡萄孢、白蜡树炭疽菌、葡萄白粉菌、斑点单囊壳、蓝莓干枯病菌、高粱柄锈菌及其任何组合。 84.如权利要求49-52所述的方法，其中所述植物、所述种子或所述其农产品选自：扁桃、杏、苹果、朝鲜蓟、香蕉、大麦、甜菜、黑莓、蓝莓、西兰花、抱子甘蓝、卷心菜、大麻、辣椒、胡萝卜、芹菜、莙荙菜、樱桃、柑橘、玉米、葫芦、海枣、无花果、大蒜、葡萄、香草、香料、羽衣甘蓝、莴苣、油棕、橄榄、洋葱、豌豆、梨、桃、花生、木瓜、欧防风、美洲山核桃、柿子、李子、石榴、马铃薯、榅桲、小萝卜、覆盆子、玫瑰、水稻、黑刺李、高粱、大豆、菠菜、草莓、甘薯、烟草、番茄、芜菁、胡桃和小麦。