基于UPLC-Q-TOF-MS/MS网络药理学的九制黄精与生黄精对脂多糖诱导RAW 264.7细胞炎症反应的抑制作用差异研究
黄精为百合科植物滇黄精Polygonatum kingianumColl. et Hemsl.、黄精Polygonatum sibiricumRed. 或多花黄精Polygonatum cyrtonemaHua的干燥根茎,是传统药食两用中药材[1]。其功效聚焦肺、脾、肾三脏,既能滋阴润肺,改善肺阴不足所致的干咳少痰、咽干口燥等症状;又能健脾益气、补气养阴,缓解脾胃虚弱引发的食欲不振、腹胀、乏力等问题;还可益肾填精,针对肾精亏虚导致的腰膝酸软、须发早白、耳鸣健忘等早衰表现发挥作用。黄精富含生物碱、皂苷、糖类、黄酮类等多种化学成分[2-4],现代药理研究证实其具有抗氧化、抗疲劳、增强免疫力及抗炎等多种生物活性[5]。生黄精因含草酸钙针晶,不仅服用时存在麻舌感[6],且具有一定毒性,故临床多采用其炮制品。九蒸九制为黄精经典炮制工艺,应用历史已逾1 800年,通过九次蒸煮、九次晒干的处理,可显著降低生黄精中草酸钙针晶含量,既减毒增效,又强化其滋补功效,对现代中药炮制研究具有重要参考价值。
炎症是机体免疫系统的防御性反应,核心目的是清除有害刺激、修复受损组织并恢复内环境稳态,既是多种疾病的核心病理过程,也可分为急性短期反应与慢性持续状态[7]。炎症的诱发因素多样,感染、组织损伤、自身免疫异常及异物入侵等均可能启动炎症反应[8-10],其中细菌、真菌、病毒等病原体入侵是主要诱因之一。病原体感染可引发炎症级联反应,导致白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)-α等促炎因子水平升高,进而激活免疫系统。在急性炎症阶段,IL-6会快速上调,通过激活免疫细胞、促进肝脏合成急性期蛋白(如C反应蛋白)等途径清除病原体并启动组织修复[11];但长期高水平的IL-6可诱发类风湿性关节炎等慢性炎症[12-13],其机制与激活信号转导与转录激活因子3(STAT3)信号通路、促进促炎因子正反馈循环及抑制抗炎因子表达相关。TNF-α作为关键促炎细胞因子,在炎症反应与病理损伤中起核心作用[14],由活化的巨噬细胞、T细胞、脂肪细胞等分泌,通过与肿瘤坏死因子受体(TNFR)1/TNFR2受体结合,激活下游核因子-κB(NF-κB)及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路,诱导促炎因子释放[15]。消除炎症不仅能缓解红、肿、热、痛等表观症状,更可通过调节免疫平衡、修复组织损伤、阻断炎症恶性循环等机制,从根本上改善机体生理功能。
网络药理学由霍普金斯于2007年提出,是融合药理学、生物信息学、计算机科学等多学科的新兴技术。该理论认为药物并非仅通过单一靶点发挥作用,而是借助多靶点相互作用实现减毒增效,其多靶点、协同作用的核心概念与中药成分复杂、多效协调的特点高度契合,为中药多成分-多靶点作用机制研究提供了全新思路。该技术可系统解析中药成分、药物靶点与疾病间的相互作用,阐明成分-靶点-疾病的关联机制及治病原理[16]。
目前国内外关于黄精作用机制的研究多聚焦于生黄精,而九制黄精作为临床常用炮制品,其在化学成分构成、药理活性及现代疾病治疗中的相关文献报道较少。为此,本研究采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析九制黄精与生黄精的化学成分差异,结合网络药理学、分子对接技术及细胞实验,在脂多糖(LPS)诱导的RAW 264.7炎症细胞模型中验证九制黄精的抗炎作用,并与生黄精进行对比。通过明确九制黄精的抗炎效应,阐明其抗炎活性与滋补功效的关联,为九制黄精的临床应用与产品开发提供科学依据。
1材料
1.1仪器
LC-40D X3型高效液相色谱仪,日本岛津公司;Zeno TOF 7600美国AB SCIEX公司;Milli-Q Synthesis 型超纯水纯化机,美国Millipore公司;CO2 Incubator BB 150细胞培养箱,美国赛默飞公司;XDS-1B生物显微镜,重庆重光实业;UV-2550紫外可见光分光光度计,日本岛津公司;HH-6恒温水浴锅,上海梅香仪器;Varioskan LUX多功能酶标仪,美国赛默飞公司;BXM-30R高压蒸汽灭菌锅,上海博讯医疗生物仪器;TGL-16M高速冷冻离心机,常州亿能实验仪器厂。
1.2试剂
1.3细胞
小鼠单核巨噬细胞(RAW 264.7),由江西中医药大学癌症中心提供。细胞使用10%胎牛血清的DMEM培养基进行培养,放入37 ℃,5% CO2恒温培养箱中培育,1~2 d换液或传代。
1.4数据库与软件
PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm. nih.gov/);TCSMP数据库(https://old.tcmsp-e.com/ tcmsp.php);Swiss Target Prediction数据库(http:// swisstarget prediction.ch/);GeneCards数据库(https://www.genecards.org/);OMIM数据库(https://www.omim.org);STRING数据库(https:// string-db.org/);NCBI 数据库(https://www. ncbi.nlm. nih.gov/);微生信(http://www. bioinformatics.com.cn/);Cytoscape 3.9.1;Peakview 1.2;SIMCA 14.1;Origin 10.1;AutoDock 4.2.6;Pymol 3.9.2。
2方法
2.1化学成分分析
2.1.1九制黄精的制备[17]生黄精洗净,除去须根。20 %黄酒浸泡1 h入蒸笼,隔水蒸制4.5 h。取出,55 ℃烘至内外湿度均匀。如此反复循环9次,至黄精色泽乌黑油润,味甘甜,得九制黄精。
2.1.2供试品溶液的制备九制黄精或生黄精粉碎(过40目筛),每份0.2 g,加5 mL 50%甲醇水,40℃、150 W、40 kHz超声提取40 min,13 000r·min−1离心10 min,取上清液,经0.22 μm微孔滤膜滤过,即得供试品溶液。
2.1.3色谱条件采用LC-40D C18(100 mm×2.1 mm,1.7 μm)色谱柱;柱温40 ℃;体积流量0.3 mL·min−1;进样量4 μL;流动相洗脱条件见表1。
2.1.4 质谱条件电子喷雾电离(ESI)源,正、负离子扫描模式,扫描范围为m/z50~1 500,离子源电压分别为5 500 V和−4 500 V,离子源温度为500 ℃,去簇电压为100 V,碰撞能量分别为(35±15)eV和(−35±15)eV,碰撞能谱(CES)为15 eV。雾化气体为氮气,辅助气体1为345 kPa,辅助气体2为345 kPa,帘气为276 kPa。
2.2数据处理
使用Peakview 1.2软件对质谱检测数据进行分析,使用Origin 2024(10.1.0.178)绘制分析离子流图,将Peakview 1.2检测得出的成分数据,以峰面积为变量使用SIMCA 14.1进行主成分分析(PCA)。
2.3网络药理学研究
2.3.1九制黄精成分靶点预测将UPLC-Q-TOF-MS/MS鉴定出的九制黄精化学成分利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),以口服生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为条件筛选符合标准的成分,利用PubChem数据库查找成分的SMILES结构,将其导入Swiss Target Prediction数据库,设定物种为“Homo sapiens”,预测各成分对应的潜在靶点。每个成分仅保留可能性>0的预测靶点,汇总所有候选成分的靶点并剔除重复项,得到九制黄精的药物靶点集。
2.3.2炎症靶点获取采用GeneCards、NCBI、OMIM数据库检索“Inflammation”关键词,汇总整理靶点信息,对数据库的检索结果去除重复项,得到炎症相关疾病的最终靶点。
2.3.3“成分-交集靶点”网络的构建采用Venny2.1.0对九制黄精成分靶点与炎症靶点取交集,得到交集靶点Venn图。
2.3.4共同靶点及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建与核心靶点筛选采用STRING数据库对交集靶点进行蛋白交互分析,交互因子设为0.4,隐藏游离靶点,将网络信息导出为“TSV”文件,网络图导出为“PNG”文件,采用Cytoscape 3.9.1软件通过拓扑分析得到网络图,采用MCODE插件筛选核心靶点,所有参数均为默认参数,选的得分最高的PPI子网络进行可视化,其颜色越深、图标越大代表度(Degree)值越大。
2.3.5基因本体(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析利用DAVID数据库对九制黄精有效成分和炎症的共同靶标进行GO和KEGG富集分析,通过微生信对显著性较强的通路与功能进行可视化。
2.4分子对接
根据网络药理学分析的结果,筛选出度值前5位的活性成分和核心靶点进行分子对接;利用AutoDock 4.2.6优化预处理后的受体蛋白、配体化合物参数,设对接区域三维坐标,借网格计算生成配置文件,再设对接框、导出GPF文件,配置参数与运算方法后运行,查看结果;采用Pymol 3.9.2对结果做可视化分析。
2.5CCK-8法检测细胞活力
2.5.1黄精提取物制备取九制黄精与生黄精适量,各加20倍的超纯水,50 ℃,功率100 W,频率40 kHz,超声提取1 h,滤过后合并滤液,重复3次,浓缩至2 g·mL−1,即得九制黄精水提物(NPA)和生黄精水提物(RPA)。经紫外分光光度计检测,NPA、RPA中总多糖质量分数分别为12.34%、16.49%,总黄酮质量分数分别为2.25%、1.84%。
2.5.2NPA和RPA质量浓度筛选取对数生长期的RAW 264.7细胞,以1×105个·mL−1的密度接种于96孔板,每孔100 μL。置于37 ℃、5% CO₂培养箱中预培养24 h(待细胞贴壁)。弃去原有培养基后分为对照组、NPA组、RPA组,其中NPA与RPA组均设置1、10、50、100、200、400、800 μg·mL−1共7个质量浓度梯度(以细胞培养基稀释配制),每组设3个复孔,置于37 ℃、5% CO₂培养箱中孵育24 h;另设空白组(仅加入细胞培养基,无细胞)。
2.5.3造模后NPA和RPA质量浓度筛选取对数生长期的RAW 264.7细胞,以1×105个·mL−1的密度接种于96孔板,每孔100 μL,置于37℃、5% CO₂培养箱中预培养24 h以确保细胞充分贴壁。弃去孔内原有培养基后,将细胞分为对照组、模型组、NPA组及RPA组。当RPA质量浓度达到800μg·mL−1时细胞活性呈下降趋势,为避免药物浓度过高对细胞活性产生非特异性影响而干扰实验结果,本实验设置100、200、400 μg·mL−1 3个质量浓度梯度,所有药物均以细胞培养基稀释配制。各组均设3个复孔,除对照组外,其余各组每孔均加入100 μL 1μg·mL−1LPS进行造模[18],随后分别加入对应质量浓度的药物;同时另设空白组,该组仅加入细胞培养基,不接种细胞。
药物干预完成后,每孔加入CCK-8检测溶液,置于37 ℃、5% CO₂培养箱中继续孵育1 h,随后使用酶标仪在490 nm波长处测定各孔吸光度(A)值,并以对照组细胞存活率为100%,计算其余各组的细胞存活率。
细胞存活率=(A实验-A空白)/(A对照-A空白)
2.6ELISA检测细胞上清液中炎症因子水平
将RAW 264.7细胞以每孔1×105个接种于6孔板中,每孔加入2 mL完全培养基,置于37 ℃、5% CO₂培养箱中培养24 h(待细胞贴壁)。弃去各孔上层培养基后进行分组处理:对照组加入2 mL不含LPS及药物的完全培养基,模型加入2 mL含1 μg·mL−1 LPS的完全培养基,药物处理组加入2 mL含1 μg·mL−1 LPS及对应质量浓度药物的完全培养基(药物质量浓度分别为100、200、400 μg·mL−1)。各组继续在相同培养条件下孵育24 h后,收集细胞上清液,采用IL-6和TNF-α检测试剂盒测定上清液中2种细胞因子的含量。
3结果
3.1质谱法对两种黄精化学成分的差异分析
九制黄精及生黄精的总离子流(TIC)图见图1。两种黄精共检测到114种化学成分,其中82种成分为两种黄精共有,21种成分仅存在于九制黄精中,11种成分仅存在于生黄精中,说明黄精经过炮制加工后,其化学成分会发生明显变化。由此可知,九制黄精的化学反应会随着其加工过程而发生变化,导致其化学成分与生黄精的化学成分有较大差异,具体差异情况见表2。
3.2 PCA
分析结果显示(图2),第1主成分的方差贡献率为56.7%,第2主成分的方差贡献率为38.1%,前2个主成分的累积方差贡献率达94.8%,可较好反映样本整体差异。图2中箭头分别对应表2所检测到的黄精化学成分差异,由图可见,九制黄精的独有成分主要包括生物碱类(5-羟基吡啶-2-甲酸甲酯)、挥发油类(thymol)、苯丙素类(皮树脂醇);而生黄精的独有成分则以氨基酸类(丝氨酸)和甾体皂苷类(liriodendrin B)为主。
上述结果揭示了九制黄精与生黄精在化学成分构成上的显著差异,这种差异可能导致二者药理作用的偏向性不同。例如,九制黄精较生黄精含有更多生物碱(如N-feruloyloctopamin)及挥发油成分(如thymol[19]、salvinori[20]),这些成分已被证实具有显著抗炎活性,其作用机制可能与抑制核因子-κB(NF-κB)、转导和转录激活因子(STAT3)等炎症信号通路,下调IL-6、TNF-α等促炎因子表达相关。此外,苯丙素类成分可能通过调控磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号轴增强免疫细胞功能。
3.3网络药理学结果
基于UPLC-Q-TOF-MS/MS分析得到的九制黄精成分,通过TCMSP数据库筛选后共获得88种成分;利用Swiss Target Prediction数据库对这些成分进行靶点预测,经去除重复靶点后得到946个成分相关靶点。在GeneCards、NCBI、OMIM数据库中检索炎症相关靶点,整合去重后获得16 208个炎症疾病靶点。取成分靶点与炎症靶点的交集,得到873个共同靶点,推测其可能是九制黄精治疗炎症的潜在靶点(图3),将91个活性成分与873个交集靶点导入Cytoscape 3.9.1软件构建PPI网络图见图4。采用Network analyzer功能,得到度值排名前5的活性成分,分别是延龄草苷(diosgenin glucoside)、N-阿魏酰真胺(N-feruloyltrueamine)、麝香草酚(thymol)、丁香脂素(syringaresinol)、静特诺皂苷元(gentrogenin)。GO分析结果按照−lgP值排序并筛选出前10的条目。如图5所示,九制黄精治疗炎症的潜在靶点在生物过程(BP)上与protein phosphorylation(蛋白磷酸化)、phosphorylation(磷酸化)、negative regulation of apoptotic process(凋亡过程负调控)等相关;在细胞组分(CC)上与plasma membrane(细胞膜)、cytoplasm(细胞质)、extracellular exosome(细胞外囊泡)、receptor complex(受体复合物)等相关;分子功能(MF)上与protein serine(蛋白丝氨酸)/threonine(苏氨酸)/tyrosine kinase activity(酪氨酸激酶活性)、identical protein binding(相同的蛋白质结合)、protein kinase activity(蛋白激酶活性)、protein tyrosine kinase activity(蛋白酪氨酸激酶)等相关。KEGG通路富集结果按富集值≥1.5、基因重叠数≥3、P<0.01进行筛选,再根据−lgP值及通路关联基因数量排序,选取前20条通路。结果显示,这些通路主要包括神经活性配体-受体相互作用、高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路及PI3K-Akt信号通路等(图6)。
3.4活性成分与核心靶点的分子对接
选定的度值排名前5种的核心成分延龄草苷、N-阿魏酰真胺蛸胺、麝香草酚、丁香脂素、静特诺皂苷元与PPI网络中排名前6的核心蛋白信号:转导和转录激活因子(STAT3)、蛋白激酶Bα(AKT1)、缺氧诱导因子1亚基α(HIF1A)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)和B细胞淋巴瘤/白血病-2基因(BCL2)进行分子对接。结合能小于0kJ·mol−1表示自发结合,结合能小于−20.95 kJ·mol−1表示结合良好,小于−29.33 kJ·mol−1表明结合活性强(表3)。核心成分与蛋白受体的结合能均小于0,表明成分与受体的直接结合良好,网络药理学结果可信度高。部分成分与靶蛋白的对接结果如图7所示。从靶标水平看STAT3、AKT1、HIF1A、TNF、IL6、BCL2 6个具有较强的结合力,可以推测这6个靶标是黄精治疗炎症的关键靶标,从化学成分水平看延龄草苷、麝香草酚、静特诺皂苷元的结合力最强,说明这3种成分是九制黄精中的关键活性成分。结合文献调查可知,这些成分和靶点与炎症、细胞凋亡等有关。
3.5RPA和NPA对RAW 264.7细胞增殖的影响
如图8所示,与对照组相比,1~400μg·mL−1的RPA和NPA对RAW 264.7细胞增殖没有显著影响。当RPA质量浓度达到800 μg·mL−1时细胞活性呈下降趋势,为避免药物浓度过高对细胞活性产生非特异性影响而干扰实验结果,后续实验选择100、200、400 μg·mL−1作为实验浓度。
3.6RPA和NPA对LPS诱导RAW 264.7细胞分泌炎症因子TNF-α和IL-6的影响
结果如图9所示。与对照组相比,模型组细胞分泌TNF-α和IL-6的水平显著升高(P<0.01);与模型组相比,NPA和RPA均能显著抑制LPS诱导的TNF-α与IL-6分泌。相同质量浓度(400 μg·mL−1)下,RPA组的TNF-α水平较NPA组更低;而各质量浓度下,RPA组的IL-6分泌量均高于NPA组(P<0.01)。
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网址: 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS网络药理学的九制黄精与生黄精对脂多糖诱导RAW 264.7细胞炎症反应的抑制作用差异研究 https://www.huajiangbk.com/newsview2533472.html
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