组蛋白甲基化修饰研究再获突破
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是过去十年来生物学领域的研究热点。LSD1是第一个被鉴定的组蛋白去甲基化酶,而LSD2是其唯一同源物,在胚胎发育过程中起重要作用。 徐彦辉课题组发现,LSD2出人意料地具有E3泛素连接酶活性,其底物为N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(OGT),LSD2泛素化OGT并促进其发生蛋白酶体依赖的降解,从而抑制OGT引起的肿瘤细胞生长。 LSD2抑制肿瘤细胞生长是依赖于其E3泛素连接酶活性,而不依赖于其组蛋白去甲基化酶活性。LSD2分别通过组蛋白去甲基化酶和E3连接酶活性调控了不同组的靶基因。该项研究发现了LSD2具备两种独立的酶活性,揭示出了LS......阅读全文
cfDNA甲基化检测能够早期检测和定位多种癌症
如果说,Illumina看见了美国泛癌早筛圣杯(GRAIL)之光,不必羡慕。因为,我们也见证了中国泛癌早筛燃石(Burning Rock)之光。两种光,虽不一样,但均照亮了泛癌早筛之路!癌症早筛,是指在看似健康的目标人群中发现未被识别的(临床前)癌症或癌前病变(在人未出现任何症状之前发现癌症),然后
城环所研究揭示蓝藻砷甲基化的分子机制
砷(As)是一种无处不在的有毒元素,砷污染问题已成为当前世界环境研究的热点之一。蓝藻广泛分布在土壤和各种水生环境中。由于它们的环境适应力强,生长速度快,因此是引起水华的主要物种。目前有关蓝藻对砷响应机制的研究还鲜有报道。 中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室朱永官组研究揭示了蓝藻砷
生态中心在汞的甲基化机理研究中取得突破
甲基汞具有神经毒性,容易在食物链中累积放大,是已知毒性最大、分布最广的有机汞化合物。除去工业生产排放以外,环境中的甲基汞被认为主要来自于微生物对无机汞的生物甲基化。在过去的几十年中,人们对其他的甲基化途径知之甚少。 中国科学院生态环境研究中心江桂斌研究组与美国FIU蔡勇教授通过合作研究,在碘甲
特异性位点的DNA甲基化的检测方法
相关专题1 甲基化敏感性限制性内切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶 对甲基化区的不切割的特性,将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析。常使用的甲基化敏感的
关于甲基化的亚硫酸氢盐测序法介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,
解锁5分m6A甲基化谱文章新思路
1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG
Nat-Commun:老化细胞中DNA甲基化扮演关键角色
尽管在每个人的一生中其机体的DNA会一直保持不变,但是科学家们却知道机体DNA在不同年龄阶段的行使的功能却并不相同。随着个体年龄增加,机体DNA的甲基化模式会发生剧烈变化,DNA的甲基化模式被认为是机体DNA的第二种遗传密码,可以控制基因的开启或关闭,然而这些改变引发的后果却依然是一个谜。 近
五花八门的DNA甲基化检测(上)
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性PCR(MS-PC
研究发现DNA甲基化参与调控柑橘成熟新机制
1月12日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为Global increase in DNA methylation during orange fruit development and r
DNA甲基化检测的序曲——亚硫酸氢盐转化
检测DNA甲基化的方法有很多种,在众多方法中,研究人员常常会使用到一项技术,那就是亚硫酸氢盐转化。DNA的亚硫酸氢盐处理将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变。随后用测序、定量PCR和芯片等分析来比较处理和未处理DNA的序列,就能确定哪些碱基是甲基化的。尽管在理论上很简单,但亚硫酸
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
DNA甲基化 实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
朱健康教授等人PNAS利用CRISPR技术解析DNA甲基化
来自中科院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组的研究人员发表了题为“Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes and inhibition of r
RNA-m6A甲基化修饰研究相关研究的应用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和组织中收集的R
北京基因组所发表RNA甲基化新发现
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m
DNA甲基转移酶与肿瘤的形成和变异
DNA甲基化有其重要的生物学上的意义,他的作用表现在控制基因表达,维护染色体的完整性(integrity)和调节DNA重组的某些环节。DNA甲基化可通过影响癌基因和抑癌基因的表达以及基因组的稳定性而参与肿瘤形成。然而,经过大量试验、研究证实,DNA甲基化是由DNA甲基转移酶(DNMT)催化发生并
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DNA甲基化有其重要的生物学上的意义,他的作用表现在控制基因表达,维护染色体的完整性(integrity)和调节DNA重组的某些环节。DNA甲基化可通过影响癌基因和抑癌基因的表达以及基因组的稳定性而参与肿瘤形成。然而,经过大量试验、研究证实,DNA甲基化是由DNA甲基转移酶(DNMT)催化发生并
研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因
βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图 近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院,首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应,相关研究结果在线发表于《自然—通讯》(Nature Communicati
胚胎干细胞“全能”秘密揭晓
瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》杂志上发表论文称,他们发现了胚胎干细胞保持“全能”的秘密:一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化,使它能发育成任何类型的细胞。 胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞,可以分化成所有类型的细胞,而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干细胞都
《自然·细胞生物学》:胚胎干细胞保持“全能”的秘密
近期瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》杂志上发表论文称,他们发现了胚胎干细胞保持“全能”的秘密:一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化,使它能发育成任何类型的细胞。 胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞,可以分化成所有类型的细胞,而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干细
天然胚胎干细胞“全能”秘密揭晓,“Pramel7”蛋白能阻止
瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》发表论文称,他们发现了天然胚胎干细胞保持“全能”的秘密:一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化,使其能发育成任何类型的细胞。 天然胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞,可以分化成所有类型的细胞,而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干
遗传发育所曹晓风团队开辟水稻表观遗传研究新方向
DNA测序技术发明之后,科学家们认为自己可以通过DNA全基因组测序解析生命的全部密码。渐渐的,他们发现有些重要信息并不编码于DNA序列里面,即便基因序列没有发生变化,生物体的表型也可以改变。这种研究被称为“表观遗传学”,继传统遗传学之后,表观遗传学如火如荼地发展起来了。曹晓风供图 中科院院士、
为植物表观遗传研究打开一扇门
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朱健康院士Nature子刊表观遗传学成果
拟南芥5-甲基胞嘧啶(5mC)DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族,是真核生物中第一个遗传表征的DNA去甲基化酶。然而,ROS1靶基因位点的特征还没有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》发表的一项研究中,来自中科院上海植物逆境生物学中心和普渡大学的研究人员,对拟南芥C
不同DNA甲基转移酶DNMT在癌症发病机制中的作用
DNA甲基化是调控基因表达最重要的表观遗传机制之一。DNA甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMT)在基因组DNA甲基化中起着至关重要的作用。在哺乳动物中,DNMT与某些元件一起调控胚胎和成体细胞的动态DNA甲基化模式。而DNMT异常功能通常是判断癌症的标志,包括抑癌基因(
李斌研究组JBC发现赖氨酸甲基化负调节IFITM3的抗病毒功能
10月16日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海巴斯德研究所李斌课题组题为Negative Regulation of Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 by SET7-media
转录因子和调节蛋白是包含关系吗
调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。
揭示H3K4me1参与RdDM途径的分子机制
2021年6月7日,Nature Communications在线发表了来自中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组和南方科技大学杜嘉木研究组合作完成的题为“Ahistone H3K4me1-specific binding protein is required
波形蛋白的临床意义
它已被用作肉瘤肿瘤标志物来识别间充质。JeradGardner对其作为生物标志物的特异性存在争议。波形蛋白基因的甲基化已被确定为结肠癌的生物标志物,这正被用于开发结肠癌的粪便测试。在某些上消化道疾病如Barrett食管、食管腺癌和肠型胃癌中也观察到波形蛋白基因甲基化的显着水平。启动子区域的高水平DN
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俞瑜副教授发现组蛋白甲基化修饰精确调控植物开花时间的新机制
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综述:如何研究植物基因组DNA羟甲基化(5hmC)?|易基因
美丽花儿背后的甲基化差异
网址: 组蛋白甲基化修饰研究再获突破 https://www.huajiangbk.com/newsview2496824.html
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