甲基磺酸甲酯处理对白花泡桐丛枝病发生基因表达变化的影响

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目录

摘要

1文献综述

1．1泡桐丛枝病的研究现状

1．1．1泡桐丛枝病病原的传播途径

1．1．2泡桐丛枝病的发病症状

1．1．3泡桐丛枝病的防治方法

1．1．4泡桐丛枝病发病机理的研究进展

1．2其他植物感染植原体的研究

1．3转录组学研究

1．3．1转录组概述

1．3．2转录组在植物抗逆中的研究

1．4权重基因共表达网络分析(WGCNA)概述

1．5本研究目的及意义

1．6技术路线

2引言

3试验材料与试验方法

3．1植物材料处理

3．2主要仪器

3．3主要试剂

3．4试验方法

3．4．1泡桐Total RNA的提取及检测

3．4．2转录组测序的文库构建和Illumina测序

3．4．3测序分析流程

3．4．4 qRT-PCR分析

3．4．5转录因子(TFs)分析及基因共表达网络构建(WGCNA)

4结果与分析

4．1转录组测序数据结果

4．1．1 Clean数据碱基组成和质量分布图

4．1．2比对效率统计

4．1．3测序数据的随机性评价

4．2 SNP／InDel分析

4．3可变剪接事件分析

4．4试剂处理患病泡桐的敏感期分析

4．5植原体侵染泡桐后差异表达基因分析

4．6 20 mg·L-1MMS处理患病幼苗后差异表达基因分析

4．7 60 mg·L-1MMS处理患病幼苗后差异表达基因的分析

4．8与丛枝病发生相关基因的分析

4．9 qRT-PCR验证

4．10基于泡桐转录组权重基因共表达网络(WGCNA)的构建

4．10．1 WGCNA构建的泡桐共表达网络

4．10．2 WGCNA构建的泡桐丛枝病共表达网络

4．10．3泡桐丛枝病模块的分析

5结论与讨论

5．1结论

5．1．1泡桐健康和患病幼苗的分析

5．1．3 60 mg·L-1MMS处理患病幼苗的分析

5．1．4与泡桐丛枝病发生相关基因的分析

5．1．5与泡桐丛枝病发生密切相关模块的分析

5．2讨论

5．2．1与泡桐丛枝形态相关的基因

5．2．2与泡桐抗病相关的基因

5．3创新点

参考文献

英文摘要

附录

攻读硕士期间发表论文和获奖情况

相关知识

白花泡桐丛枝病发生相关ceRNA研究
不同坡向、坡位对白花泡桐幼龄林生长的影响
白花泡桐花的化学成分研究
白花泡桐上山造林技术初探
改良白花泡桐组织培养及快速繁殖
白花泡桐上山造林研究初报
白花泡桐PfLAC对泡桐丛枝植原体的响应
白花泡桐种子萌发特性的研究
《Mol Plant》泡桐速生及泡桐丛枝病形成的机理研究
泡桐埋根造林

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