棉花所科研人员完成了苹果GDSL基因家族的全基因组鉴定及进化图谱分析

近日，棉花所农业废弃物资源化利用团队共同完成了苹果(Malus × domestica) GDSL基因家族的全基因组鉴定及进化图谱分析，相关研究成果以“Genome-Wide Identification and Evolution-Profiling Analysis of The GDSL gene family in apple (Malus × domestica)”为题发表在《Agronomy》（IF=3.3，农林科学2区）上。

GDSL脂肪酶在对非生物胁迫的响应和植物生长中起着至关重要的作用，GDSL基因的表达受到冷害、高盐、伤害和水杨酸等多种胁迫因素的诱导。虽然已经在一些植物中发现了GDSL基因家族，但在苹果中缺乏全面的全基因组鉴定和分析。

在本研究中，该团队鉴定了苹果基因组中分布在17条染色体上的4个亚科131个MdGDSLs。这些MdGDSLs的分子量（MW）在14.44 ~ 83.26 kDa之间，等电点（PI）在4.32 ~ 10.09之间。同一亚群的成员表现出相似的基因结构和保守的基序。此外，全基因组重复（WGD）对MdGDSL基因家族的进化有重要贡献。MdGDSL基因的启动子区域包含许多与非生物应激和激素反应相关的顺式元件。同时，该团队开展了针对苹果花器官低温胁迫和苹果叶片高盐胁迫等非生物胁迫验证。RNA-seq数据表明苹果全基因组中MdGDSL基因对高浓度CaCl2和冷胁迫处理有反应。该研究为进一步研究苹果的生长发育和脂质代谢机制提供了理论基础。

该研究得到了山西农业大学科技创新提升工程、山西省基础研究、国家重点研发计划、山西农业大学棉花研究所科研发展基金等项目资助。山西农业大学棉花研究所袁嘉玮为该文第一作者，梁哲军为该文共同第一作者，山西农业大学棉花研究所张建诚研究员为通讯作者。

原文链接：https://doi.org/10.3390/agronomy15030517

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