两种锦鸡儿转录组的产生，分类和CYC / TB1基因的分子进化,Plant Diversity

Croomia属（Stemonaceae）是研究东亚（EA）-北美东部（ENA）植物区系分离以及花形形成的遗传机制的绝佳模型。除了该属中的肌动花和合子花外，其他物种在EA和ENA之间是分离分布的。但是，由于基因组资源的可用性有限，很少有Croomia的研究来研究这些问题。在这项研究中，我们对合子开花的Cromoheterosepalpala和猕猴桃属开花的Croomia japonica的花和叶转录组进行测序，并使用比较基因组学方法研究了两个密切相关物种的转录组进化。异花假丝酵母（ChFlower）花转录组的测序和从头组装，C. japonica（CjFlower）的花朵和C. japonica（CjLeaf）的叶子分别产生了Unigenes的57,193、62,131和64,448个单基因。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。japonica（CjFlower）和C.japonica（CjLeaf）的叶分别产生单基因57,193、62,131和64,448。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。japonica（CjFlower）和C.japonica（CjLeaf）的叶分别产生单基因57,193、62,131和64,448。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。C.Leaponica（CjLeaf）的叶片和叶分别产生57,193、62,131和64,448个单基因。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。C.Leaponica（CjLeaf）的叶片和叶分别产生57,193、62,131和64,448个单基因。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。分别为131和64,448个单基因。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。分别为131和64,448个单基因。此外，估计ChFlower和CjFlower之间的11,566个潜在直系同源基团的Ka / Ks比表明，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。ChFlower和CjFlower之间的566个潜在直系同源基团显示，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。ChFlower和CjFlower之间的566个潜在直系同源基团显示，只有六对具有明显大于1的Ka / Ks比，并且可能处于正选择状态。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。在这项研究中，总共鉴定出429个单拷贝核基因（SCNG）和21,460个表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）。具体来说，我们从菊科中鉴定了七个CYC / TB1样基因。系统发育和分子进化分析表明，这些CYC / TB1样基因形成了单系进化枝（SteTBL1），并受到强烈的纯化选择。菊科花对称性的变化似乎与TBL拷贝数无关。

"点击查看英文标题和摘要"

相关知识

科学网—[文献翻译]CYC/TB1基因家族在菊科中的进化与分化
兰科花卉TCP基因生物信息学分析及蝴蝶兰CYC
中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及.PDF 文档全文预览
植物所揭示花对称性形态分化的分子调控进化机制
旱寒胁迫下锦鸡儿基因SSH文库构建及抗逆侯选功能基因资源挖掘
向日葵lpm花发育过程中基因差异表达分析及其与HaCYC2c的互作研究
中科院植物所发现一类基因对花形花朝向和花色关联进化起重要作用
Plant Cell | 中科院植物所王印政研究组在花形、花朝向和花色关联进化研究中取得新进展
基于泛转录组学分析不同色系报春苣苔属植物花色素苷差异积累的机制
徐麟研究组揭示植物根分生组织的分子进化历程

网址: 两种锦鸡儿转录组的产生，分类和CYC / TB1基因的分子进化,Plant Diversity https://www.huajiangbk.com/newsview2175922.html