牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用

作者：杨勇 王顺利 薛璟祺 任秀霞 李丹丹 杨若...牡丹管家基因系统发生进化

摘要：利用RT-PCR技术从牡丹组7个野生种和1个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因（ubiquitin,UBI）、素环蛋白基因（cyclophilin,CYP）、肌动蛋白基因（Actin）、葡萄糖六磷酸脱氢酶基因（glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase,G6PD）和β–微管蛋白基因（beta-tubulin,TUB）等5个管家基因的编码序列（coding sequence,CDS）。序列比对分析发现,5个管家基因序列均相对保守,其在牡丹7个野生种和1个栽培种中的保守性在99.04%~99.69%。利用5个管家基因分别构建了其在牡丹组8份材料中的系统进化树。5个系统进化树均将8份材料分成两组,即革质花盘亚组和肉质花盘亚组;由于5个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同,在区分亚组成员间略有差异。综合分析5个管家基因构建的系统进化树可知,杨山牡丹（Paeonia ostii）和栽培牡丹（P.suffruticosa‘Luoyanghong’）常聚为一支,二者亲缘关系较近,因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成;紫斑牡丹（P.rockii）和四川牡丹（P.decomposita）一直聚为一支,推测二者亲缘关系较近;黄牡丹（P.lutea）和紫牡丹（P.delavayi）一直聚为一支,推测这二者亲缘关系较近。狭叶牡丹（P.potaninii）与黄牡丹和紫牡丹分化较早,结合前人研究结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种。

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