世界首个野生梨基因组图谱完成
原标题:世界首个野生梨基因组图谱完成
本报讯(记者黄哲雯)记者获悉,中国农科院果树研究所研究员曹玉芬团队与中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队,日前合作组装了高质量的杜梨参考基因组序列——这是世界首个野生梨的基因组图谱,也是我国在梨基因组学研究领域又一重大研究进展。
该基因组的公布丰富了梨属植物基因组信息,同时将为梨基因组研究、功能基因挖掘、梨属植物驯化以及野生资源利用提供重要保障。
据曹玉芬团队介绍,科研人员以山西杜梨为材料,结合PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技术,组装了高质量的杜梨参考基因组序列。具体来看,杜梨基因组组装大小为532.7兆,contig N50为1.57兆,共有59552个蛋白质编码基因和247.4兆重复序列被注释,通过BUSCO对基因组完整性进行评估,完整性达到95.9%。
研究认为,杜梨扩张基因在次生代谢通路中显著富集,可能进而影响杜梨较强的逆境适应性。分析结果显示,驯化过程中,东方梨的果实大小、糖代谢和转运,以及光合效率受到正向选择。
研究同时发现,梨属植物在驯化过程中果实酸涩味逐渐消失。杜梨原花青素合成结构基因拷贝数显著多于白梨,影响了原花青素的积累,同时花青素还原酶代谢途径是原花青素合成的唯一途径,山梨醇转运蛋白跨膜转运可能是影响可溶性有机物质积累的主要因素。
相关知识
世界首个兰花全基因组测序完成
世界首个兰花全基因组测序完成—论文—科学网
世界首个兰花全基因组测序完成 有望破解遗传奥秘
世界首个兰花全基因组测序工作在深圳完成
科学家主导完成梨基因组研究,为新品种培育提供宝贵资源
世界首个梅花全基因组重测序研究完成
两岸科学家领衔的国际团队完成世界首个兰花基因组全景图
两岸科学家领衔的国际团队完成世界首个兰花基因组全景图 技术要闻
科学网—首个兰花全基因组测序完成
首个梅花全基因组重测序研究完成,论文在《自然通讯》发表
网址: 世界首个野生梨基因组图谱完成 https://www.huajiangbk.com/newsview1891251.html
上一篇: 西双版纳红香酥梨树苗、红宝石梨树 |
下一篇: 野生梨花朵图片 |
推荐分享

- 1君子兰什么品种最名贵 十大名 4012
- 2世界上最名贵的10种兰花图片 3364
- 3花圈挽联怎么写? 3286
- 4迷信说家里不能放假花 家里摆 1878
- 5香山红叶什么时候红 1493
- 6花的意思,花的解释,花的拼音 1210
- 7教师节送什么花最合适 1167
- 8勿忘我花图片 1103
- 9橄榄枝的象征意义 1093
- 10洛阳的市花 1039