破译野生大麦种质抗玉米叶蚜 Rhopalosiphum maidis 的遗传多样性和种群结构 (Fitch),Scientific Reports

破译野生大麦种质抗玉米叶蚜 Rhopalosiphum maidis 的遗传多样性和种群结构 (Fitch)
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2023-10-12 , DOI: 10.1038/s41598-023-42717-7
Sunny Maanju 1, 2 , Poonam Jasrotia 1 , Surender Singh Yadav 2 , Prem Lal Kashyap 1 , Sudheer Kumar 1 , Manoj Kumar Jat 2 , Chuni Lal 1 , Preeti Sharma 2 , Gyanendra Singh 1 , Gyanendra Pratap Singh 1, 3

玉米叶蚜 (CLA- Rhopalosiphum maidis ) 是大麦 ( Hordeum vulgare )的主要害虫，严重侵扰时可导致产量损失高达 30%。鉴于大麦中 CLA 抗性来源非常少，本研究旨在使用针对R. maidis 的8 个微卫星标记来评估 43 个野生大麦（ H. vulgare subsp. spontaneum ）基因型的遗传多样性和群体结构。 。三种统计方法即。多变量层次聚类、贝叶斯聚类和 PCoA 将基因型一致分为三个亚群 (K = 3)，其中 25.58% (SubPop1-Red)、39.53% (SubPop2-Green) 和 34.88% (SubPop3-Blue) 基因型（包括混合物）。基于 Q ≥ 66.66%，37.20% 的基因型形成了表面的“混合/混合”亚群。所有多态性 SSR 标记均生成 36 个等位基因，平均为 4.5 个等位基因/基因座（2-7 范围）。PIC 和 H 在 MS31 中最高，在 MS28 中最低，平均值分别为 0.66 和 0.71。MAF和平均遗传多样性分别为0.16%和89.28%。所有这些参数表明所研究的基因型中存在主要的遗传多样性和种群结构。根据 AII，仅发现 6 种基因型对R.maidis具有抗性。SubPop3 具有 91.66%（11）的耐药或中度耐药基因型。SubPop3 还具有最纯的基因型 (11)、最少的蚜虫侵染 (8.78) 和最高的 GS (0.88)，表明其适合未来R.maidis抗性育种计划。

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更新日期：2023-10-15

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