全球气候变化背景下野生大麦早花的适应性进化机制

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目录

第一章 绪论

1．1 全球气候变化及其对生物多样性的影响

1．2 植物对全球气候变化的响应

1．2．1 植物通过调整开花时间响应全球气候变化

1．2．2 模式植物开花时间基因调控网络的研究进展

1．3 野生大麦对全球气候变化的响应

1．3．1 野生大麦适应全球气候变化的研究进展

1．3．2 野生大麦通过开花时间的调整适应全球气候变化

1．4 群体遗传学概述

1．4．1 群体遗传学主要相关理论

1．4．2 适应性进化的研究方法及其进展

1．5 本研究的内容及意义

1．5．1 研究内容

1．5．2 实验技术路线

1．5．3 创新性和意义

第二章 研究材料及研究方法

2．1 野生大麦种质资源收集与扩繁

2．2 实验方法

2．2．1 基因组总DNA提取、检测及保存

2．2．2 候选基因(candidate gene)多态性引物筛选

2．2．3 参考基因(reference gene)多态性引物筛选

2．2．4 候选基因及参考基因片段扩增、纯化与测序

2．3 实验数据的处理分析

2．3．1 DNA序列比对及校正

2．3．2 遗传多样性分析

2．3．3 群体遗传结构分析(Population Structure)

2．3．4 中性检测

2．3．5 局域适应性分析

2．3．6 时间尺度各SNP／Indel位点的选择系数估算

2．3．7 基因间连锁不平衡分析

第三章 实验结果

3．1 遗传多样性

3．2 群体遗传结构

3．3 中性检测

3．4 遗传分化及局域适应性

3．4．1 FST-outlier及群体间遗传分化

3．4．2 SNP／Indel与气候因子之间的关联分析

3．5 WFABC选择系数估算

3．6 连锁不平衡

第四章 讨论

4．1 野生大麦局域适应性进化

4．2 野生大麦通过平行进化提前开花

4．3 野生大麦遗传多样性的变化

第五章 结论和展望

5．1 结论

5．2 展望

参考文献

附件

致谢

作者简历及攻读博士学位期间发表的学术论文与研究成果

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