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花绒寄甲不同发育阶段转录组比较分析

来源:花匠小妙招 时间:2025-01-17 22:22
学位专题>西北农林科技大学>花绒寄甲不同发育阶段转录组比较分析

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第一章 文献综述

1.1.1 形态学特征

1.1.2 生活史

1.1.3 人工饲养概况

1.1.4 生物防治

1.1.5 分子生物学研究

1.2 与昆虫发育相关的分子学研究进展

1.3 转录组技术

1.3.1 转录组及测序技术简介

1.3.2 RNA-seq技术在昆虫中的研究进展及应用

1.4 实时荧光定量PCR技术概述

1.5 研究目的及意义

1.6 研究技术路线

第二章 材料与方法

2.1.1 试验昆虫

2.1.2 主要试剂

2.1.3 主要仪器设备

2.1.4 主要生物信息学分析软件

2.2 试验方法

2.2.1 总RNA提取及检测

2.2.2 cDNA文库构建及上机测序

2.2.3 转录组测序原始数据处理

2.2.4 Clean Reads与参考基因组比对分析

2.2.5 基因表达量分析及差异表达基因的筛选

2.2.6 差异表达基因富集分析

2.2.7花绒寄甲生长发育相关基因RT-qPCR分析

第三章 结果与讨论

3.1 花绒寄甲所有样品RNA质检结果

3.2 花绒寄甲所有样品RNA-seq数据质控结果

3.3 花绒寄甲不同发育阶段RNA-seq数据与参考基因组的比对分析

3.4 基因表达量分析

3.5 RNA-seq整体质量评估及相关性分析

3.6.1 差异表达基因统计

3.6.2 差异表达基因聚类分析

3.7 花绒寄甲不同发育阶段共有差异表达基因的研究

3.8 花绒寄甲不同发育阶段差异表达基因的GO富集分析

3.8.1 幼虫期 VS 蛹期差异表达基因GO富集分析

3.8.2 成虫期 VS 蛹期差异表达基因GO富集分析

3.8.3 成虫期 VS 幼虫期差异表达基因GO富集分析

3.8.4 成虫期差异表达基因GO富集分析

3.9 花绒寄甲不同发育阶段差异表达基因的KEGG富集分析

3.9.1幼虫期 VS 蛹期成虫期差异表达基因KEGG富集分析

3.9.2成虫期 VS 蛹期差异表达基因KEGG富集分析

3.9.3成虫期 VS 幼虫期差异表达基因KEGG富集分析

3.9.4 成虫期差异表达基因KEGG富集分析

3.10.1 候选基因在不同发育阶段的相对表达量

3.10.2 荧光定量结果与RNA-seq结果综合分析

第四章 结论与展望

4.1 研究结论

4.2 展望

参考文献

附录

致谢

个人简历

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花绒寄甲不同发育阶段转录组比较分析

赵星
西北农林科技大学

摘要:

花绒寄甲(Dastarcushelophoroides)是多种林木害虫,尤其是天牛类害虫的重要天敌。利用花绒寄甲对天牛进行生物防治,具有安全、高效且持续性强的特点,且在适宜的饲养条件下,花绒寄甲的寿命较长,而且能持续进行有性繁殖,其特殊性为研究昆虫繁殖的生理与分子机制提供了宝贵的资源。为探索花绒寄甲生长发育的分子机制,本研究利用高通量测序平台IlluminanovaseqTM6000分别对4龄幼虫(L1)、6龄幼虫(L2)、蛹(…展开v

关键词:花绒寄甲;转录组学;基因差异表达;RT-qPCR;生物防治

授予单位:西北农林科技大学

授予学位:硕士

学科专业:林学

导师姓名:唐光辉

学位年度:2021

语种:中文

分类号:S763.38

在线出版日期:2022-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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网址: 花绒寄甲不同发育阶段转录组比较分析 https://www.huajiangbk.com/newsview1615310.html

所属分类:花卉
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