武汉植物园莲遗传连锁图谱研究取得进展
美洲黄莲‘AL1’遗传连锁图谱
遗传连锁图谱是研究植物基因组结构、进化的有力工具,是基因定位、克隆和分子标记辅助育种的重要基础。但作为被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之称的莲,其基因组学研究却明显滞后。因此,构建莲遗传连锁图谱有助于莲基因组学研究的快速发展,为莲重要经济性状的分离和克隆提供依据,从而有利于进一步探索和充分利用莲的观赏、食用和药用价值。
水生植物资源学科组首先扫描了中国古代莲基因组序列,发现了86,089个SSR位点,其中73,246个SSR位点可用于开发SSR引物。然后以亚洲莲品种‘中国古代莲’和美洲黄莲品种‘AL1’杂交F1群体为材料,根据中国古代莲基因组序列信息开发的部分SSR分子标记(500对)分别构建了‘中国古代莲’和‘AL1’的遗传连锁图谱。由于‘中国古代莲’的基因组杂合度比较低,此图谱仅包含7个连锁群,有47个标记,图谱长度为365.67 cM。‘AL1’图谱包含11个连锁群,有177个分子标记,图谱长度为524.51 cM。这是首次报道莲的遗传连锁图谱,为莲基因组学研究奠定了良好基础,加快了莲重要基因定位、克隆和分子标记辅助育种的进程。
该研究成果以“Genetic linkage maps for Asian and American lotus constructed using novel SSR markers derived from the genome of sequenced cultivar”为题在BMC Genomics(doi:10.1186/1471-2164-13-653)上在线发表。
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(水生植物资源学科组 杨美韩 艳妮)
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