对优势沙漠草原羽草 Stipa breviflora Griseb 的遗传多样性和局部适应性的基因组洞察。,Frontiers in Plant Science

对优势沙漠草原羽草 Stipa breviflora Griseb 的遗传多样性和局部适应性的基因组洞察。
Frontiers in Plant Science ( IF 4.1 ) Pub Date : 2023-05-17 , DOI: 10.3389/fpls.2023.1170075
Dongqing Yan 1 , Jiamei Liu 1 , Yanyan Fan 1 , Zhi Lian 1 , Zhenhua Dang 1, 2, 3 , Jianming Niu 1, 2, 3

研究局部适应的遗传机制对于理解物种如何适应异质环境至关重要。在本研究中，我们分析了限制性位点相关 DNA 测序 (RADseq) 数据，以探索遗传多样性、遗传结构、遗传分化和局部适应性。短花针茅. 总共对 135 株植物进行了测序，获得了 25,786 个多态位点。我们发现遗传多样性低（他= 0.1284) 在人群中短花海棠. 沿其分布范围确定了四个遗传簇。Mantel 检验、部分 Mantel 检验和随机化多元矩阵回归 (MMRR) 表明种群分化是由地理距离和环境因素共同造成的。通过F英石异常值测试和环境关联分析 (EAA)，113 个候选基因座被确定为假定的适应性基因座。收入客公里2和 CPRF1，它们分别与分生组织维持和光响应相关，被注释。探索气候因子对遗传分化和地方适应的影响短花海棠，梯度森林 (GF) 分析分别应用于 25,786 个单核苷酸多态性 (SNP) 和 113 个候选基因座。结果表明，温度和降水均影响短花海棠，降水与当地适应密切相关。我们的研究为了解当地的适应性提供了理论基础短花海棠.

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更新日期：2023-05-17

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