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用于检测小麦成株期抗条锈病主效位点QYr.hnk

来源：花匠小妙招时间：2025-01-03 02:50

用于检测小麦成株期抗条锈病主效位点QYr.hnk-7DL的KASP标记的制作方法

本发明属于生物，具体涉及一种用于检测小麦成株期抗条锈病主效位点qyr.hnk-7dl的kasp标记。

背景技术：

1、传统的小麦条锈病抗性育种是以人工接菌或自然发病的形式创造有利的发病条件，通过表型鉴定进行后代选择。然而，不同年份的光照、温度、湿度和菌系等各种发病条件的不同严重限制了条锈病抗性育种工作的进行。

2、随着分子生物学的发展，国内外许多育种家越来越重视对小麦抗病基因的研究和应用，通过开发与抗病基因紧密连锁的分子标记，可以在分子水平上对亲本材料及其后代个体进行抗病基因的种类和数量的检测，更加科学合理的配置组合，并在早期世代就可以对目标基因进行选择。

3、单核苷酸多态性(snp)标记，由于其能够快速、高通量筛查并适用于基因分型等优点，已被广泛开发应用于各项研究领域。近年来，随着基因组学的快速发展，小麦snp标记的开发和应用得到了相当大的发展，9k、15k、55k、90k、660k、820k等不同密度的小麦snp芯片相继被开发，基于功能性snp位点，开发与基因功能相关的kasp标记将是未来分子标记的发展方向。

技术实现思路

1、qyr.hnk-7dl为新鉴定的小麦成株期抗条锈病主效位点，为了将其更好的应用于小麦条锈病抗性育种实践，需要开发与其紧密连锁的分子标记用于辅助选择。本发明提供了用于检测位于小麦染色体7dl上的snp ax-11172000(633539394bp处)的基因型或与其连锁的成株期小麦抗条锈病主效位点qyr.hnk-7dl的kasp标记kasp-yrzm1354引物序列及其小麦抗条锈病育种或其他方面中的应用。

2、本发明采用以下技术方案：

3、本发明提供一种用于检测小麦染色体7dl上的snp ax-11172000的基因型的产品，所述产品包括：

4、(1)用于检测小麦染色体7dl上的snp ax-11172000的基因型的引物组合物；

5、所述引物组合物包括：

6、forward primer-f1：

7、5’-gaaggtgaccaagttcatgctatggcctcagcaatacgagca-3’；

8、forward primer-f2：

9、5’-gaaggtcggagtcaacggattatggcctcagcaatacgagcg-3’；

10、reverse primer-r：

11、5’-asgggatgcagataacacatc-3’；其中，s为c或g；

12、fam荧光标记序列为5’-gaaggtgaccaagttcatgct-3’；

13、hex荧光标记序列为5’-gaaggtcggagtcaacggatt-3’；

14、(2)含有(1)中所述引物组合物的试剂或试剂盒。

15、本发明还提供了上述的产品在以下方面的应用，其特征在于，

16、(a)鉴定或辅助鉴定或比较待测小麦材料的成株期条锈病抗性；

17、(b)选育或筛选成株期抗条锈病的小麦株系、品系或品种。

18、本发明又提供一种鉴定小麦成株期条锈病抗性的方法，该方法是利用上述的产品对待测小麦材料基因组dna进行pcr反应，读取pcr扩增产物的荧光颜色；

19、若所述待测的pcr扩增产物的荧光显示为红色，则代表检测基因型为gg；

20、若所述待测的pcr扩增产物的荧光显示为蓝色，则代表检测基因型为aa；

21、若所述待测的pcr扩增产物的荧光显示为绿色，则代表检测基因型为ag；

22、基因型为aa的小麦材料的成株期抗条锈病能力高于基因型为gg的小麦材料。

23、本发明又提供一种成株期抗条锈病小麦育种方法，包括以下内容：

24、检测小麦染色体7dl上的snp ax-11172000的基因型，该处核苷酸多态性为a或g，所述snp位点处基因型为aa时，该小麦为成株期抗条锈病材料，所述snp位点处基因型为gg时，该小麦为成株期感条锈病材料；

25、根据育种目标选择相应基因型的小麦材料作为亲本、选择后代并进行鉴定。

26、本发明的有益效果为：

27、本发明将snp ax-111720006开发成便于检测的kasp标记kasp-yrzm1354，该标记在小麦材料中的分型结果与660k小麦snp芯片分型结果完全一致。kasp-yrzm1354可作为高精度分子标记用于筛选小麦抗条锈病种质资源。位点qyr.hnk-7dl在该群体的小麦成株期条锈病抗性中发挥着重要作用，kasp标记在小麦抗条锈病分子辅助育种中是可用的。

技术特征：

1.用于检测小麦染色体7dl上的snp ax-11172000的基因型的产品，其特征在于，所述产品包括：

2.检测权利要求1中所述的产品在以下方面的应用，其特征在于，

3.一种鉴定小麦成株期条锈病抗性的方法，其特征在于，利用权利要求1中所述的产品对待测小麦材料基因组dna进行pcr反应，读取pcr扩增产物的荧光颜色；

4.一种成株期抗条锈病小麦育种方法，其特征在于，包括以下内容：

技术总结
本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于检测小麦成株期抗条锈病主效位点QYr.hnk‑7DL的KASP标记。本发明提供一种用于检测小麦染色体7DL上的SNP AX‑11172000的基因型的产品，包括：（1）用于检测小麦染色体7DL上的SNP AX‑11172000的基因型的引物组合物；（2）含有（1）中所述引物组合物的试剂或试剂盒。本发明还提供了上述产品在以下方面的应用：（a）鉴定或辅助鉴定或比较待测小麦材料的成株期条锈病抗性；（b）选育或筛选成株期抗条锈病的小麦株系、品系或品种。

技术研发人员：许为钢,杜习军,张煜,彭超军,齐学礼,董海滨,昝香存,郝向阳
受保护的技术使用者：河南省作物分子育种研究院
技术研发日：
技术公布日：2024/10/31