观赏植物紫花洋地黄的基因组序列揭示了花色和形态变异的分子基础,bioRxiv
紫毛洋地黄(毛地黄)是一种分布广泛的观赏植物,也是生物医学化合物地高辛的生产者。在这里,我们提出了红色开花 D. purpurea 植物的基于长读测序的基因组序列以及相应的基因模型预测。 4.3 Mbp 的 N50 表明了组装的高连续性,并且发现了约 96% 完整的 BUSCO 基因,证明了组装的完整性。该基因组资源为深入研究 D. purpurea 的花色素沉着铺平了道路。鉴定了花青素生物合成的结构基因和相应的转录调节因子。红色和白色开花植物的比较揭示了白色开花植物中花青素合酶基因的大量插入,这很可能使该基因失去功能,并可以解释花青素色素沉着的丧失。此外,花青素生物合成激活剂 MYB5 在白色开花植物中显示出 18 bp 缺失,导致蛋白质中 6 个氨基酸丢失。此外,我们发现 DpTFL1/CEN 基因中的大量插入负责大型顶生花的发育。
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