首页 分享 系统发育树的美化(iTOL)

系统发育树的美化(iTOL)

来源:花匠小妙招 时间:2024-12-29 17:07

最新推荐文章于 2024-11-05 17:06:37 发布

—━沉☆默づ 于 2023-06-09 10:55:04 发布

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。

#小白详细操作教程

1.打开网址iTOL: Interactive Tree Of Life

2.注册登录

 

3. 点击My Trees →+Tree upload(为Newick文件,后缀为.nwk),可以上传文本格式和文件格式

 

 4.点击所上传的文件,就可以看到进化树进行修改美化了

5.美化

我一般用到以下几步:

5.1基础操作

5.1.1更改进化树形状-系统默认为最合适的,但也可根据需求更改

 


5.1.2更改根结点-将鼠标放在进化树一个枝干上,右击,点击Tree structure→Root the tree at midpoint

 

5.1.3更改标签字号大小

 

5.1.4加粗进化树枝条

 

结果呈现:

5.2高级操作

5.2.1显示步长,并放大100倍比例

5.3更改标签背景

5.3.1手动更改,将鼠标放在所要更改的标签所在的线条上,右击鼠标

 

5.3.2添加注释文件

 

5.4更改标签位置

如果你想把这些基因进行分组,但是所得到的进化树不是你想要的,那可以进行位置的调整

将鼠标放在所要更改的枝条上,右击,点击进行旋转,这个经常会被覆盖住,所以常被忽略,如下图所示:

 

 以上就是使iTOL进行系统发育树的简单美化了,我还在继续学习中,之后会进行分享,希望能帮助到大家,这些都是我在网上自学的,走了不少弯路,大家有更好的方法,还请分享哈

相关知识

系统阐述被子植物系统发育基因组学研究进展
昆明植物所研究团队发表被子植物系统发育基因组学与“生命之树”研究综述
昆明植物所解析核心十字花科植物的系统发育关系
种质库团队解析核心十字花科植物的系统发育关系
桃属植物系统发育演化关系之分析
丁香属3种植物完整叶绿体基因组与系统发育研究
广义花楸属的系统发育及分类学修订
张国进博士在菊科系统发育与分子进化方面的研究取得新进展
被子植物的对起源与系统发育.ppt
科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展

网址: 系统发育树的美化(iTOL) https://www.huajiangbk.com/newsview1356799.html

所属分类:花卉
上一篇: 铜钱草的意义与寓意(以铜钱草为纽
下一篇: 大花金鸡菊作用用途

推荐分享