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特约综述 | 陈露-玉米野生种基因组研究进展及应用
玉米野生种基因组研究进展及应用
胡伊娃,陈露
DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-1131
玉米(Zea mays ssp. mays)的野生近缘种,被统称为大刍草(teosinte)。大刍草主要包括5个种,7个亚分类群,具体可以分为小颖大刍草,墨西哥大刍草,多年生大刍草,四倍体多年生大刍草,繁茂大刍草,尼加拉瓜大刍草。大刍草拥有对多种环境的适应能力,在炎热潮湿的低地、温暖干旱的山谷等地域都可以生存。
在快速的驯化过程中,玉米不仅在形态和生殖器官上与大刍草发生了巨大的分化,在分子水平上也发生了明显的变化。由于驯化瓶颈的作用,现代玉米已经丢失了大量的遗传多样性,包括大量对生物和非生物胁迫的抗性基因,缺乏应对气候变化的有利突变。对大刍草的深入认知,挖掘大刍草中的有益位点,是未来气候变化下保证玉米稳定生产的关键途径之一。
近日,《生物技术通报》特别邀请浙江大学农业与生物技术学院陈露研究员团队发表综述《玉米野生种基因组研究进展及应用》。本文主要综述了大刍草的基因组进化、数量遗传学、群体遗传学等方面的研究进展,同时对大刍草在未来玉米遗传育种中的应用进行了展望。
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本文主要包括以下几部分内容:
1 玉蜀黍属的演化历史
1.1 栽培玉米的起源
1.2 大刍草的系统发育关系
2 大刍草与玉米的差异
2.1 大刍草与玉米的性状差异
2.2 大刍草与玉米的基因组差异
3 大刍草在玉米遗传学上的应用
3.1 玉米表型变异数量性状位点的鉴定
3.2 玉米表型变异关键基因鉴定
4 展望
栽培玉米狭窄的遗传基础是制约高产、抗性玉米新品种选育的重要因素。大刍草可以作为重要的遗传资源,使得育种家能通过引入近缘物种的等位基因来改良现代玉米。然而,当前对大刍草遗传多样性的挖掘,主要集中在玉米直系祖先parviglumis及其姐妹种mexicana上的几个有限单株上,对大刍草全部遗传多样性的利用还非常滞后。随着一些大刍草亲本定位群体的开发,这个问题可能会有一定的改善。此外,目前对其他大刍草特性的认知仍然非常少,极大地忽略了其他大刍草在玉米遗传学、农业生产实践上的潜在应用价值。例如,diploperennis具有超强的体细胞再生能力,luxurians可以作为良好的青贮饲料。
更重要的是,进一步的野外考察又报道了一些新的、形态和分布上与上述7个大刍草具有显著差异的物种。例如2011年于墨西哥的Nayarit、Michoacan、Oaxaca发现的3种大刍草,2013年于哥斯达黎加的Murcielago群岛上发现的Zea vespertilio。值得注意的是,这些物种的群体非常小,并且栖息地还受到人类活动的威胁。未来作物遗传资源的保护应该不局限于作物本身,还应加强对已有野生资源的保护及未知野生种质资源的考察与鉴定。
随着高通量组学测序技术的发展,在多个水平解析植物基因组的特征也变得越来越容易。伴随着越来越多大刍草基因组的发表,基因功能验证方法飞速发展,大刍草转基因平台的建立,大刍草中有利位点的快速发掘将更为简单。野生种质资源的解析,驯化前优异等位基因的发掘与利用,将加速适应性玉米新品种的培育进程。
作者简介
陈露,博士。浙江大学“新百人计划”研究员,博士生导师。现工作于浙江大学农业与生物技术学院,作物科学研究所。课题组主要从组学大数据出发,探索作物驯化与适应性演化的遗传机制。近年来在《Science》、《Nature Genetics》、《Molecular Plant》等国际知名期刊上发表研究论文12篇。
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